More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2346 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2346  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
361 aa  716    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  71.75 
 
 
369 aa  508  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  71.75 
 
 
369 aa  508  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  68.8 
 
 
364 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5256  Beta-N-acetylhexosaminidase  70.11 
 
 
363 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.973302  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  67.32 
 
 
352 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  67.74 
 
 
543 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  66.2 
 
 
352 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0593  Beta-N-acetylhexosaminidase  64.8 
 
 
367 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1407  glycoside hydrolase family 3 domain protein  66.01 
 
 
368 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  64.43 
 
 
347 aa  421  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  58.52 
 
 
342 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  58.52 
 
 
342 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  58.36 
 
 
342 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  58.36 
 
 
342 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  58.36 
 
 
342 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  58.36 
 
 
342 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0846  beta-hexosaminidase  58.19 
 
 
343 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0495446  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  58.07 
 
 
342 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2247  beta-hexosaminidase  58.26 
 
 
349 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  58.07 
 
 
342 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  58.07 
 
 
342 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  57.42 
 
 
349 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  58.1 
 
 
342 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  58.82 
 
 
342 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  56.82 
 
 
349 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  58.54 
 
 
342 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  58.26 
 
 
342 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  58.54 
 
 
342 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  56.82 
 
 
349 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  57.87 
 
 
342 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1735  beta-hexosaminidase  58.76 
 
 
342 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0532306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  57.98 
 
 
342 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  55.97 
 
 
350 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0418  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.78 
 
 
357 aa  354  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0411  glycoside hydrolase family 3 protein  54.37 
 
 
357 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  52.52 
 
 
349 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  54.09 
 
 
359 aa  298  7e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  52.25 
 
 
349 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  50.87 
 
 
381 aa  285  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  50.34 
 
 
355 aa  279  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.44 
 
 
347 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2034  beta-hexosaminidase  47.89 
 
 
339 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.362016  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  50.34 
 
 
337 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  47.49 
 
 
347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  47.06 
 
 
333 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  48.81 
 
 
333 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  50.34 
 
 
336 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  47.95 
 
 
344 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  47.83 
 
 
337 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  50.34 
 
 
336 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  50.34 
 
 
336 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.46 
 
 
346 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  49.84 
 
 
341 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  48.48 
 
 
342 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  47.81 
 
 
342 aa  256  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  47.81 
 
 
341 aa  256  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  49.66 
 
 
332 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  49.31 
 
 
336 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  47.47 
 
 
342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  49.66 
 
 
356 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  46.8 
 
 
342 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  48.28 
 
 
336 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.25 
 
 
362 aa  252  6e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  47.14 
 
 
342 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  48.28 
 
 
336 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  43.9 
 
 
357 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  48.28 
 
 
336 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  50 
 
 
336 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  45.58 
 
 
313 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  45.24 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1716  beta-hexosaminidase  42.58 
 
 
332 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  41.23 
 
 
337 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  45.27 
 
 
337 aa  239  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  44.84 
 
 
341 aa  238  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  44.03 
 
 
334 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  44.97 
 
 
341 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  49.13 
 
 
327 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2523  beta-hexosaminidase  48.48 
 
 
342 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.352424  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2416  beta-hexosaminidase  48.48 
 
 
342 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  44.97 
 
 
341 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.97 
 
 
341 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  44.97 
 
 
341 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  45.48 
 
 
365 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  44.97 
 
 
341 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  44.97 
 
 
341 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2405  beta-hexosaminidase  48.48 
 
 
342 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.842865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1943  beta-hexosaminidase  48.15 
 
 
342 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.531769  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  45.48 
 
 
341 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  45.48 
 
 
341 aa  236  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  45.15 
 
 
341 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1132  beta-hexosaminidase  39.83 
 
 
351 aa  233  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00323913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  45.64 
 
 
348 aa  232  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  44.63 
 
 
343 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  44.83 
 
 
360 aa  230  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  44.63 
 
 
343 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  44.63 
 
 
342 aa  229  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.64 
 
 
348 aa  228  8e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  44.37 
 
 
356 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  44.48 
 
 
360 aa  227  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>