More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2413 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  100 
 
 		 349 aa  711    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2247  beta-hexosaminidase  89.11 
 
 		 349 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  79.82 
 
 		 350 aa  557  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  77.94 
 
 		 349 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  77.01 
 
 		 349 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  67.46 
 
 		 342 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  68.06 
 
 		 342 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  68.06 
 
 		 342 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  68.06 
 
 		 342 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  68.06 
 
 		 342 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  67.16 
 
 		 342 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  68.06 
 
 		 342 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  68.06 
 
 		 342 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  68.06 
 
 		 342 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  69.85 
 
 		 342 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  69.55 
 
 		 342 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  69.55 
 
 		 342 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  69.85 
 
 		 342 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  69.67 
 
 		 342 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0846  beta-hexosaminidase  69.25 
 
 		 343 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0495446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  68.66 
 
 		 342 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  68.96 
 
 		 342 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1735  beta-hexosaminidase  68.36 
 
 		 342 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0532306  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0411  glycoside hydrolase family 3 protein  64.57 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0418  Beta-N-acetylhexosaminidase  64 
 
 		 357 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  60.47 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  58.38 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.15 
 
 		 364 aa  381  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  57.23 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2346  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.42 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.94 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.94 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0593  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.23 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  57.7 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1407  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.37 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5256  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.46 
 
 		 363 aa  359  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.973302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  55.14 
 
 		 543 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  53.01 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  57.23 
 
 		 359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  58.96 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  52.12 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  53.77 
 
 		 337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  52.58 
 
 		 333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  51.37 
 
 		 337 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.93 
 
 		 347 aa  302  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  47.77 
 
 		 341 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  50.48 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  52.92 
 
 		 342 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2034  beta-hexosaminidase  48.66 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.362016  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  52.41 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  52.07 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  52.41 
 
 		 342 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  50.17 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.48 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  48.52 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  46.79 
 
 		 344 aa  294  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  48.35 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  53.93 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  52.86 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  53.42 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  53.57 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  53.57 
 
 		 336 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  53.77 
 
 		 336 aa  289  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  53.57 
 
 		 332 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  53.57 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  53.21 
 
 		 336 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  49.19 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  52.14 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  49.84 
 
 		 360 aa  285  7e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  49.52 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  52.82 
 
 		 341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.15 
 
 		 348 aa  282  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  46.13 
 
 		 357 aa  281  9e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.93 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  54.51 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1716  beta-hexosaminidase  47.62 
 
 		 332 aa  278  9e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  47.38 
 
 		 342 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  48.99 
 
 		 337 aa  276  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  46.15 
 
 		 348 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02440  beta-hexosaminidase  48.76 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  46.85 
 
 		 365 aa  272  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  47.34 
 
 		 342 aa  272  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  46.34 
 
 		 334 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.14 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  45.14 
 
 		 341 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  45.14 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  45.14 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  44.83 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  45.14 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  45.14 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  44.83 
 
 		 341 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  44.83 
 
 		 341 aa  262  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2416  beta-hexosaminidase  50.71 
 
 		 342 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2523  beta-hexosaminidase  50.71 
 
 		 342 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.352424  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  45.96 
 
 		 339 aa  261  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2405  beta-hexosaminidase  50.71 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.842865  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1132  beta-hexosaminidase  41.82 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00323913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1943  beta-hexosaminidase  50.71 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.531769  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  48.14 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  48.14 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>