More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0548 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  100 
 
 
342 aa  692    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  100 
 
 
342 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  99.71 
 
 
342 aa  690    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  99.42 
 
 
342 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  100 
 
 
342 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  100 
 
 
342 aa  692    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  99.42 
 
 
342 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1735  beta-hexosaminidase  93.86 
 
 
342 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0532306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  79.24 
 
 
342 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  81.87 
 
 
342 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  78.95 
 
 
342 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  81.87 
 
 
342 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  81.87 
 
 
342 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  81.87 
 
 
342 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  82.49 
 
 
342 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  80.99 
 
 
342 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  81.29 
 
 
342 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0846  beta-hexosaminidase  76.32 
 
 
343 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0495446  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  68.06 
 
 
349 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2247  beta-hexosaminidase  66.47 
 
 
349 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  64.67 
 
 
349 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  64.37 
 
 
350 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  64.37 
 
 
349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0411  glycoside hydrolase family 3 protein  57.93 
 
 
357 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0418  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.76 
 
 
357 aa  411  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  58.38 
 
 
352 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.06 
 
 
369 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.06 
 
 
369 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  57.8 
 
 
352 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.87 
 
 
364 aa  384  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2346  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.36 
 
 
361 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  59.17 
 
 
347 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  58.11 
 
 
543 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5256  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.14 
 
 
363 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.973302  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0593  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.55 
 
 
367 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1407  glycoside hydrolase family 3 domain protein  57.8 
 
 
368 aa  359  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  54.24 
 
 
349 aa  344  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  53.64 
 
 
349 aa  342  5e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  58.47 
 
 
381 aa  335  9e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.46 
 
 
347 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  56.63 
 
 
359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2034  beta-hexosaminidase  49.85 
 
 
339 aa  319  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.362016  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  51.95 
 
 
336 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  50.3 
 
 
341 aa  309  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  50.74 
 
 
347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  52.24 
 
 
336 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  50.76 
 
 
355 aa  297  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  49.27 
 
 
332 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  51.23 
 
 
356 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.19 
 
 
362 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  50.9 
 
 
336 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  54.64 
 
 
336 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  50.52 
 
 
337 aa  291  8e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  49.7 
 
 
336 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  47.27 
 
 
357 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  49.55 
 
 
336 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  48.07 
 
 
337 aa  289  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  49.85 
 
 
336 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  49.4 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  44.28 
 
 
344 aa  286  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  49.84 
 
 
333 aa  285  8e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  49.52 
 
 
360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.11 
 
 
348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  51.79 
 
 
360 aa  282  5.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  50.17 
 
 
342 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  52.07 
 
 
342 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  49.04 
 
 
356 aa  279  6e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  50.9 
 
 
327 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  52.14 
 
 
342 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  51.79 
 
 
342 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.34 
 
 
346 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  52.14 
 
 
342 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1716  beta-hexosaminidase  47.76 
 
 
332 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  47.26 
 
 
341 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  48.79 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  46.25 
 
 
333 aa  268  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  48 
 
 
334 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02440  beta-hexosaminidase  48.39 
 
 
340 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  45.7 
 
 
342 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  45.99 
 
 
342 aa  259  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  45.07 
 
 
313 aa  259  7e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  47.16 
 
 
365 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  45.87 
 
 
337 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  44.41 
 
 
313 aa  255  8e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  49.83 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  47.54 
 
 
341 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  46.89 
 
 
343 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  46.89 
 
 
343 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  47.28 
 
 
340 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  47.21 
 
 
341 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.21 
 
 
341 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  47.21 
 
 
341 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  47.21 
 
 
341 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  47.21 
 
 
341 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  47.21 
 
 
341 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  47.21 
 
 
341 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  46.89 
 
 
341 aa  249  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2416  beta-hexosaminidase  49.49 
 
 
342 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  45.32 
 
 
337 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2523  beta-hexosaminidase  49.49 
 
 
342 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.352424  normal  0.669465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>