More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2837 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  100 
 
 		 333 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  73.87 
 
 		 337 aa  527  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  70.03 
 
 		 355 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  68.5 
 
 		 342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  68.5 
 
 		 342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  67.89 
 
 		 342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  68.5 
 
 		 342 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  67.89 
 
 		 342 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  66.97 
 
 		 333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  63 
 
 		 341 aa  433  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2416  beta-hexosaminidase  66.97 
 
 		 342 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2405  beta-hexosaminidase  66.97 
 
 		 342 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.842865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1943  beta-hexosaminidase  66.97 
 
 		 342 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.531769  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2523  beta-hexosaminidase  66.97 
 
 		 342 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.352424  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  64.2 
 
 		 337 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  61.26 
 
 		 341 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1716  beta-hexosaminidase  54.67 
 
 		 332 aa  317  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  53.12 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  51.54 
 
 		 365 aa  316  4e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  50.61 
 
 		 339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  48.32 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  49.22 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.22 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  49.22 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  50.61 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  48.91 
 
 		 341 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  49.22 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  49.22 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  49.22 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  49.22 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  48.91 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  54.27 
 
 		 349 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  49.07 
 
 		 341 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  49.07 
 
 		 341 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  49.07 
 
 		 341 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  49.07 
 
 		 341 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  49.07 
 
 		 341 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  51.38 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  48.62 
 
 		 342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  52.58 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02440  beta-hexosaminidase  53.45 
 
 		 340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  49.55 
 
 		 349 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  50.15 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.11 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  51.72 
 
 		 342 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  46.33 
 
 		 343 aa  295  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2247  beta-hexosaminidase  52.92 
 
 		 349 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  46.33 
 
 		 343 aa  295  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  46.33 
 
 		 340 aa  295  8e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  49.84 
 
 		 342 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  49.19 
 
 		 342 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1132  beta-hexosaminidase  50.17 
 
 		 351 aa  293  4e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00323913  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  47.42 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  48.2 
 
 		 359 aa  288  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  47.16 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  49.35 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  50.86 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  50.34 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  51.08 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  50.72 
 
 		 360 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  49.84 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  49.84 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  49.84 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  49.84 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  50.52 
 
 		 349 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  49.84 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  49.84 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  49.84 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  53.61 
 
 		 342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  53.61 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  53.61 
 
 		 342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  53.26 
 
 		 342 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  53.26 
 
 		 342 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  53.26 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  52.92 
 
 		 342 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  49.32 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  48.77 
 
 		 330 aa  280  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0846  beta-hexosaminidase  47.88 
 
 		 343 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0495446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  48.99 
 
 		 352 aa  278  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  51.72 
 
 		 356 aa  278  9e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  47.85 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  47.74 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  53.05 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  52.07 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  50.81 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 		 347 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0418  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.49 
 
 		 357 aa  276  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  47.24 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  51.04 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  51.61 
 
 		 336 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1735  beta-hexosaminidase  51.89 
 
 		 342 aa  272  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0532306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  46.79 
 
 		 327 aa  271  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  52.33 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  51.25 
 
 		 336 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0411  glycoside hydrolase family 3 protein  44.19 
 
 		 357 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5256  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.88 
 
 		 363 aa  268  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.973302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  50.9 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2346  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.81 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  51.25 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.74 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>