More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1398 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 362 aa  730    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  53.5 
 
 		 357 aa  339  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  55.31 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  50.15 
 
 		 349 aa  325  6e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  54.11 
 
 		 341 aa  325  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.94 
 
 		 348 aa  324  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  55.93 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  53.35 
 
 		 347 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  50.31 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.19 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  49.05 
 
 		 342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  46.87 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  47.66 
 
 		 350 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  45.57 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0411  glycoside hydrolase family 3 protein  48.62 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.07 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  50.48 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  50.16 
 
 		 349 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  50.16 
 
 		 349 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  48.19 
 
 		 342 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2034  beta-hexosaminidase  49.84 
 
 		 339 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.362016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  48.19 
 
 		 342 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  48.19 
 
 		 342 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  48.19 
 
 		 342 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  48.34 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  48.34 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  48.34 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0418  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.99 
 
 		 357 aa  292  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2247  beta-hexosaminidase  53.08 
 
 		 349 aa  292  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  49.06 
 
 		 356 aa  292  6e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  55.32 
 
 		 347 aa  292  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  52.13 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  52.76 
 
 		 333 aa  288  9e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  49.83 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  52.92 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  50.82 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  52.58 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  53.9 
 
 		 336 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  51.76 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  52.23 
 
 		 342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5256  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.04 
 
 		 363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.973302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.17 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  51.06 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0846  beta-hexosaminidase  49.21 
 
 		 343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0495446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  52.23 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  50.69 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  52.05 
 
 		 341 aa  281  9e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.49 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  53.19 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  51.55 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  50.65 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.49 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  52.84 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  51.72 
 
 		 342 aa  279  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  49.05 
 
 		 342 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  49.37 
 
 		 342 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  49.37 
 
 		 342 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  49.68 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  50.69 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  49.05 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  49.05 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  53.19 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1735  beta-hexosaminidase  46.83 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0532306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  51.42 
 
 		 354 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.42 
 
 		 354 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  52.84 
 
 		 332 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  52.48 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  52.13 
 
 		 336 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  52.13 
 
 		 336 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  52.84 
 
 		 336 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  51.42 
 
 		 336 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1716  beta-hexosaminidase  45.7 
 
 		 332 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  51.21 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1407  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.75 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0593  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.43 
 
 		 367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  48.11 
 
 		 333 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  50.16 
 
 		 543 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02440  beta-hexosaminidase  46.39 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  48.58 
 
 		 337 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  53.76 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  50.69 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  52.28 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01728  beta-hexosaminidase  49.13 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1525  beta-hexosaminidase  50 
 
 		 335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.276065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2346  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.25 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2416  beta-hexosaminidase  52.58 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2523  beta-hexosaminidase  52.58 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.352424  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1943  beta-hexosaminidase  52.58 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.531769  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2405  beta-hexosaminidase  52.58 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.842865  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  46.69 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  46.69 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  41.06 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  41.06 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  41.06 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  41.06 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  41.06 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1132  beta-hexosaminidase  41.12 
 
 		 351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00323913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  44.3 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  41.9 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  50.53 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>