More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2160 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  91.79 
 
 		 341 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  91.79 
 
 		 341 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  92.38 
 
 		 341 aa  655    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  92.08 
 
 		 341 aa  652    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  100 
 
 		 341 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  91.5 
 
 		 341 aa  651    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  100 
 
 		 341 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  91.79 
 
 		 341 aa  653    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  100 
 
 		 341 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  92.08 
 
 		 341 aa  654    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  92.08 
 
 		 341 aa  654    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  100 
 
 		 341 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  91.79 
 
 		 341 aa  650    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  100 
 
 		 341 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  88.13 
 
 		 337 aa  614  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  79.64 
 
 		 339 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  76.18 
 
 		 342 aa  543  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  75 
 
 		 342 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  75.44 
 
 		 343 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  75.44 
 
 		 343 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  74.63 
 
 		 340 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  71.68 
 
 		 365 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  69.91 
 
 		 348 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  55.39 
 
 		 330 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  53.43 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  55.76 
 
 		 327 aa  364  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  56.06 
 
 		 327 aa  364  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1132  beta-hexosaminidase  49.85 
 
 		 351 aa  351  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00323913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  55.48 
 
 		 337 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  51.52 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  51.94 
 
 		 342 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1716  beta-hexosaminidase  54.48 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  48.4 
 
 		 344 aa  318  7.999999999999999e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  50.3 
 
 		 341 aa  318  9e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  50.29 
 
 		 342 aa  316  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  50.29 
 
 		 342 aa  316  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  50.59 
 
 		 342 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  49.85 
 
 		 347 aa  312  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  50 
 
 		 342 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  47.08 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.48 
 
 		 348 aa  309  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  52.41 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  49.07 
 
 		 333 aa  305  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  47.49 
 
 		 341 aa  305  7e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  54.64 
 
 		 341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02440  beta-hexosaminidase  47.38 
 
 		 340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  48.18 
 
 		 337 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  51.52 
 
 		 336 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  53.29 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  50.61 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  48.34 
 
 		 336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  48.81 
 
 		 340 aa  288  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  47.18 
 
 		 334 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  49.51 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  48.05 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2405  beta-hexosaminidase  48.96 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.842865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2523  beta-hexosaminidase  48.96 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.352424  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2416  beta-hexosaminidase  48.96 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1943  beta-hexosaminidase  48.96 
 
 		 342 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.531769  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  47.89 
 
 		 336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  48.04 
 
 		 336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  47.59 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  47.59 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  48.16 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  46.05 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  52.13 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  43.07 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  50 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.92 
 
 		 346 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  49.15 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  44 
 
 		 313 aa  266  5e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  43.69 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  48.23 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  44.2 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  46.64 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2247  beta-hexosaminidase  45.2 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  47 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  44.69 
 
 		 349 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  43.67 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.64 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  46.6 
 
 		 347 aa  249  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.06 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  43.41 
 
 		 350 aa  246  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  45.16 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  43.88 
 
 		 342 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  43.88 
 
 		 342 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  43.88 
 
 		 342 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  43.88 
 
 		 342 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  43.88 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  43.88 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  43.88 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0418  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.57 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  44.59 
 
 		 342 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  43.92 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  44.27 
 
 		 342 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5256  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.01 
 
 		 363 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.973302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  42.99 
 
 		 342 aa  235  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2034  beta-hexosaminidase  42.42 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.362016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.45 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  46.43 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>