More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0223 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  100 
 
 		 330 aa  682    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  75.46 
 
 		 327 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  75.38 
 
 		 327 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  67.59 
 
 		 331 aa  484  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  58.08 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  57.75 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  57.78 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  55.99 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  55.39 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  55.99 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  56.29 
 
 		 341 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.59 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  55.89 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  56.59 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  56.89 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  56.29 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  56.59 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  56.59 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  56.85 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  56.29 
 
 		 341 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  56.59 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  55.39 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  55.39 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  55.39 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  55.39 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  55.39 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  55.93 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1132  beta-hexosaminidase  50.15 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00323913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  48.07 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  54.88 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1716  beta-hexosaminidase  49.7 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  49.51 
 
 		 349 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  48.96 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  51.86 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  51.01 
 
 		 349 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  46.27 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  45.91 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  48.77 
 
 		 333 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  46.2 
 
 		 342 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  51.03 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  46.36 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02440  beta-hexosaminidase  45 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  49.69 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  48.33 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  45.61 
 
 		 342 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  46.13 
 
 		 347 aa  272  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  48.61 
 
 		 336 aa  272  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  45.91 
 
 		 342 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.95 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  48.01 
 
 		 332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  47.84 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  52.5 
 
 		 336 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  48.14 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  53.05 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  48.46 
 
 		 336 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  47.99 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  47.68 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  46.39 
 
 		 337 aa  262  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  50 
 
 		 347 aa  262  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  49.49 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  46.81 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  49.48 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  43.79 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  48.2 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  51.04 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  44.85 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.69 
 
 		 346 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2416  beta-hexosaminidase  45.32 
 
 		 342 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2405  beta-hexosaminidase  45.32 
 
 		 342 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.842865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2523  beta-hexosaminidase  45.32 
 
 		 342 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.352424  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  42.98 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01728  beta-hexosaminidase  48.75 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1943  beta-hexosaminidase  45.32 
 
 		 342 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.531769  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  42.73 
 
 		 360 aa  245  6e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  45.15 
 
 		 349 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0418  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.12 
 
 		 357 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  42.24 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2034  beta-hexosaminidase  45.05 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.362016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  42.77 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  42.14 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  42.77 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2247  beta-hexosaminidase  43.87 
 
 		 349 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.54 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  47.31 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  44.79 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  44.14 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  44.04 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  43.05 
 
 		 313 aa  235  6e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1525  beta-hexosaminidase  46.95 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.276065  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  41.87 
 
 		 350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.73 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.33 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.73 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  42.71 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0411  glycoside hydrolase family 3 protein  44.12 
 
 		 357 aa  232  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  41.37 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  41.99 
 
 		 342 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  40.48 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  41.37 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  41.37 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>