More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0793 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 
350 aa  707    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  73.28 
 
 
351 aa  525  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  41.19 
 
 
354 aa  273  3e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.5 
 
 
373 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  36.34 
 
 
481 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.92 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  38.42 
 
 
374 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.62 
 
 
373 aa  200  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.36 
 
 
382 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  36.76 
 
 
375 aa  196  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  38.3 
 
 
378 aa  194  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.59 
 
 
398 aa  193  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  36.44 
 
 
393 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.92 
 
 
395 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.96 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  33.33 
 
 
382 aa  189  8e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  32.89 
 
 
382 aa  185  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.78 
 
 
379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  33.62 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.42 
 
 
381 aa  183  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  35.77 
 
 
358 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.27 
 
 
358 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.31 
 
 
375 aa  179  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  35.21 
 
 
358 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.93 
 
 
490 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.74 
 
 
403 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.72 
 
 
586 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  36.92 
 
 
520 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.86 
 
 
484 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.75 
 
 
492 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  31.8 
 
 
520 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  32.11 
 
 
503 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  33.43 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.21 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.71 
 
 
345 aa  159  9e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.23 
 
 
511 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  31.78 
 
 
386 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01720  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.75 
 
 
383 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651137  normal  0.324393 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.23 
 
 
528 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.09 
 
 
490 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.46 
 
 
558 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.87 
 
 
598 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  32 
 
 
478 aa  149  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  35.56 
 
 
427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.01 
 
 
420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4457  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30 
 
 
388 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149935  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.64 
 
 
698 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.23 
 
 
511 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 
365 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.57 
 
 
348 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.61 
 
 
504 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  31.04 
 
 
499 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  34.88 
 
 
344 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 
444 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  31.38 
 
 
365 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.9 
 
 
543 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  33.09 
 
 
498 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.5 
 
 
845 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.94 
 
 
365 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.94 
 
 
365 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.9 
 
 
364 aa  142  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  32.65 
 
 
589 aa  142  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  30.14 
 
 
656 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  31.17 
 
 
699 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  30.5 
 
 
734 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  32.07 
 
 
552 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  30.3 
 
 
688 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  32.71 
 
 
699 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  32.71 
 
 
699 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  32.71 
 
 
699 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10240  lipoprotein lpqI  30.61 
 
 
388 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000940475  normal  0.839336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.91 
 
 
618 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  32.25 
 
 
997 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  29.97 
 
 
575 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  35.36 
 
 
333 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  29.65 
 
 
575 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.18 
 
 
346 aa  136  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.07 
 
 
594 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0385  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.58 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  30.23 
 
 
356 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.55 
 
 
573 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  33.97 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  32.36 
 
 
517 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  35.42 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  30.08 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  31.62 
 
 
673 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  32.25 
 
 
585 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  31.63 
 
 
363 aa  133  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.07 
 
 
482 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.88 
 
 
543 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  32.84 
 
 
337 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  33.21 
 
 
333 aa  132  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  34.35 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.34 
 
 
534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.94 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  30.56 
 
 
528 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.68 
 
 
582 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.34 
 
 
534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  33.21 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  33.21 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>