More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0385 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0385  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 390 aa  754    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4513  glycoside hydrolase family 3 protein  45.51 
 
 		 388 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.662398  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3777  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.71 
 
 		 408 aa  239  8e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0155235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0110  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.24 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0523  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.73 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.328579  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08090  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.56 
 
 		 421 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0781  beta-glucosidase-like glycosidase  36.72 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  30.58 
 
 		 350 aa  136  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  31.3 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.86 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.31 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  30.57 
 
 		 481 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  26.25 
 
 		 354 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.01 
 
 		 367 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.73 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.27 
 
 		 426 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  34.42 
 
 		 335 aa  109  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  31.73 
 
 		 541 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.34 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.22 
 
 		 343 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4457  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 388 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149935  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.51 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.16 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.18 
 
 		 379 aa  106  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.08 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.03 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  27.43 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.17 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.48 
 
 		 586 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.64 
 
 		 403 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.4 
 
 		 511 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.27 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.56 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.72 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.46 
 
 		 558 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  29.84 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01720  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.47 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651137  normal  0.324393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  29.87 
 
 		 382 aa  99.8  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.09 
 
 		 337 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  29.07 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  26.74 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.39 
 
 		 698 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  34.57 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  33.09 
 
 		 328 aa  97.8  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.97 
 
 		 395 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.91 
 
 		 339 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  34.91 
 
 		 348 aa  97.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  34.21 
 
 		 342 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.17 
 
 		 392 aa  96.7  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.15 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  33.97 
 
 		 335 aa  96.3  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.31 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01728  beta-hexosaminidase  33.76 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.29 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  30.51 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.46 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.51 
 
 		 353 aa  94.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  27.98 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  31.52 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  32.12 
 
 		 327 aa  93.2  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  32.23 
 
 		 341 aa  92.8  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2332  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.41 
 
 		 409 aa  92.8  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.12 
 
 		 341 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  29.78 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1525  beta-hexosaminidase  34.74 
 
 		 335 aa  92.8  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.276065  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  35.24 
 
 		 575 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.96 
 
 		 341 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  27.88 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  32.48 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  32.22 
 
 		 338 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  33.55 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.87 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  31.25 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  33.2 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  33.09 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.64 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  34.59 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  35.08 
 
 		 327 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.55 
 
 		 308 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  27.99 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  34.89 
 
 		 575 aa  90.1  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.79 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0897745 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0689  glycoside hydrolase family 3 protein  25.88 
 
 		 443 aa  90.5  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  33.09 
 
 		 342 aa  90.1  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.1 
 
 		 341 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0119  glycoside hydrolase family 3 protein  29.31 
 
 		 467 aa  90.1  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  30.63 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  31.21 
 
 		 354 aa  90.1  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.21 
 
 		 354 aa  90.1  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  31.78 
 
 		 337 aa  89.4  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.53 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  29.8 
 
 		 337 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  33.09 
 
 		 341 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  33.09 
 
 		 341 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  30.48 
 
 		 517 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2290  glycoside hydrolase family 3 protein  34.73 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>