More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4513 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4513  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 388 aa  764    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.662398  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3777  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.67 
 
 		 408 aa  314  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0155235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0523  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.79 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.328579  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0385  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.51 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0110  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.53 
 
 		 418 aa  236  7e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0781  beta-glucosidase-like glycosidase  39.82 
 
 		 392 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08090  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.87 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 		 386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.95 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.56 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  36.7 
 
 		 481 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.71 
 
 		 398 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.81 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  31.64 
 
 		 351 aa  130  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  33.05 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  33.43 
 
 		 656 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  30.59 
 
 		 557 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  28.77 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  32.31 
 
 		 604 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  32.32 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  31.97 
 
 		 517 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.49 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 		 444 aa  123  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2332  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.28 
 
 		 409 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.37 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.59 
 
 		 586 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.29 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  27.51 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  32.7 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.58 
 
 		 698 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.47 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  28.67 
 
 		 541 aa  116  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  28.08 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  28.77 
 
 		 393 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  31.48 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.12 
 
 		 543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.03 
 
 		 511 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.56 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.35 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.24 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.11 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.16 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.81 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  30.29 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.12 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.25 
 
 		 558 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  32.01 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  25.63 
 
 		 382 aa  109  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2290  glycoside hydrolase family 3 protein  35.29 
 
 		 429 aa  109  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  33.21 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3167  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.86 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  33.01 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  28.82 
 
 		 990 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  31.82 
 
 		 552 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.24 
 
 		 580 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.86 
 
 		 1018 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.43 
 
 		 596 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4457  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.28 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149935  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 		 624 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  24.93 
 
 		 531 aa  105  9e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  25.35 
 
 		 382 aa  106  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  35.18 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1221  glycosy hydrolase family protein  26.24 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  30.88 
 
 		 1012 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  25.38 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01728  beta-hexosaminidase  30.45 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  28.79 
 
 		 618 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  29.92 
 
 		 631 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  23.68 
 
 		 845 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  30.38 
 
 		 575 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.64 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  29.69 
 
 		 585 aa  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.9 
 
 		 511 aa  103  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  27.09 
 
 		 971 aa  103  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  29.29 
 
 		 1003 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  31.38 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.16 
 
 		 600 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  29.53 
 
 		 997 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  32.1 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  33.43 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36 
 
 		 339 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.21 
 
 		 339 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1007 aa  99  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.89 
 
 		 530 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.58 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0897745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.57 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.64 
 
 		 543 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.8 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.6 
 
 		 478 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  33.8 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  32.06 
 
 		 503 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  31.34 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  30.97 
 
 		 327 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  33.61 
 
 		 337 aa  97.1  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  36.32 
 
 		 337 aa  96.7  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  30.8 
 
 		 370 aa  96.7  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  28.65 
 
 		 592 aa  96.3  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.14 
 
 		 490 aa  96.3  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  30.22 
 
 		 337 aa  96.3  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.22 
 
 		 594 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>