More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0110 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0110  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
418 aa  798    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3777  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.35 
 
 
408 aa  335  7.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0155235  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0523  Beta-glucosidase-related glycosidase  44.75 
 
 
403 aa  287  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.328579  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0385  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.59 
 
 
390 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4513  glycoside hydrolase family 3 protein  46.28 
 
 
388 aa  246  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.662398  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0781  beta-glucosidase-like glycosidase  40.22 
 
 
392 aa  197  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08090  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.57 
 
 
421 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.49 
 
 
358 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.64 
 
 
392 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  36.79 
 
 
481 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  35.84 
 
 
386 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.55 
 
 
375 aa  133  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.99 
 
 
426 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.28 
 
 
367 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.44 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.17 
 
 
373 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  34.14 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  34.14 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  34.14 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  34.14 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  34.14 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  31.81 
 
 
374 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  30.86 
 
 
393 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.14 
 
 
353 aa  123  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.36 
 
 
395 aa  123  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.85 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  34.6 
 
 
365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  31.21 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  30.35 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  35.64 
 
 
340 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 
444 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.02 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.81 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.02 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  31.99 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  36.88 
 
 
347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  32.27 
 
 
337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  32.88 
 
 
341 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.7 
 
 
398 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  32.88 
 
 
341 aa  117  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  32.88 
 
 
341 aa  117  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  32.88 
 
 
341 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.19 
 
 
341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  32.88 
 
 
341 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.22 
 
 
353 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  30.06 
 
 
375 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.58 
 
 
586 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  32.76 
 
 
365 aa  114  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  33.1 
 
 
348 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  33.97 
 
 
656 aa  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 
365 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  32.53 
 
 
341 aa  112  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  32.19 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  32.65 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  35.25 
 
 
381 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.71 
 
 
362 aa  110  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.23 
 
 
387 aa  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  31.59 
 
 
575 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  32.19 
 
 
341 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.54 
 
 
381 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.45 
 
 
698 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.97 
 
 
379 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  31.71 
 
 
330 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  32.33 
 
 
357 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  32.32 
 
 
427 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3167  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.02 
 
 
438 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  36.5 
 
 
342 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.73 
 
 
528 aa  107  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.89 
 
 
348 aa  106  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  27.2 
 
 
350 aa  106  7e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.83 
 
 
341 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  31.44 
 
 
343 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  31.44 
 
 
343 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2290  glycoside hydrolase family 3 protein  34.28 
 
 
429 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  31.44 
 
 
340 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  32.42 
 
 
333 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.44 
 
 
308 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  29.58 
 
 
351 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  32.59 
 
 
328 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  32.19 
 
 
342 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  31.27 
 
 
341 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.97 
 
 
351 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  31.25 
 
 
349 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.29 
 
 
343 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  29.76 
 
 
327 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  30.3 
 
 
342 aa  103  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0846  beta-hexosaminidase  31.29 
 
 
343 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0495446  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.83 
 
 
583 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02440  beta-hexosaminidase  29.97 
 
 
340 aa  102  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  32.23 
 
 
359 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.93 
 
 
343 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  26.5 
 
 
520 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  29.51 
 
 
511 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2332  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.14 
 
 
409 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  27.93 
 
 
382 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.29 
 
 
339 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01720  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.16 
 
 
383 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651137  normal  0.324393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  33.9 
 
 
341 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  24.43 
 
 
528 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  30.49 
 
 
356 aa  101  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>