More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0781 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0781  beta-glucosidase-like glycosidase  100 
 
 
392 aa  791    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0523  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.7 
 
 
403 aa  229  6e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.328579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4513  glycoside hydrolase family 3 protein  39.82 
 
 
388 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.662398  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3777  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.83 
 
 
408 aa  206  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0155235  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0110  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.87 
 
 
418 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08090  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.82 
 
 
421 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0385  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.72 
 
 
390 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.05 
 
 
426 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  31.31 
 
 
481 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.37 
 
 
373 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.34 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.14 
 
 
379 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  27.09 
 
 
382 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  27.68 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.61 
 
 
698 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  26.88 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.68 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0897745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.26 
 
 
375 aa  109  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.63 
 
 
398 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  27.45 
 
 
374 aa  106  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.81 
 
 
367 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  29.01 
 
 
656 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.12 
 
 
382 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.35 
 
 
381 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.61 
 
 
845 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  27.96 
 
 
520 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 
444 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.94 
 
 
543 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  25.66 
 
 
541 aa  100  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 
386 aa  99.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1221  glycosy hydrolase family protein  25.28 
 
 
400 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  26.67 
 
 
350 aa  99.4  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.11 
 
 
511 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  30.77 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  28.57 
 
 
575 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  31.22 
 
 
557 aa  97.4  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3167  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.93 
 
 
438 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252076 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.51 
 
 
358 aa  96.3  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  30.97 
 
 
575 aa  96.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.17 
 
 
586 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  28.24 
 
 
517 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.11 
 
 
528 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  29.19 
 
 
1007 aa  94.7  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2332  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.85 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.99 
 
 
373 aa  93.2  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  24.93 
 
 
734 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.16 
 
 
543 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  27.22 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.24 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  28.68 
 
 
511 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.65 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  28.17 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.17 
 
 
478 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4457  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30 
 
 
388 aa  90.5  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149935  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  26.47 
 
 
618 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  26.87 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  24.72 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.8 
 
 
337 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.6 
 
 
387 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  26.51 
 
 
393 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4322  putative Beta-hexosaminidase  29.13 
 
 
476 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127427  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.66 
 
 
365 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.12 
 
 
490 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  29.66 
 
 
365 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.01 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0117  glycoside hydrolase family 3 protein  29 
 
 
465 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  27.02 
 
 
490 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  29.66 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0119  glycoside hydrolase family 3 protein  28.57 
 
 
467 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  29.66 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  29.66 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  29.66 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  29.66 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.12 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  30 
 
 
499 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  24.72 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.24 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01720  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  27.25 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651137  normal  0.324393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  24.77 
 
 
990 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  26.3 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.09 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10240  lipoprotein lpqI  29.13 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000940475  normal  0.839336 
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  30.77 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.59 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  26.29 
 
 
604 aa  83.2  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  28.15 
 
 
492 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  23.65 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  31.23 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.42 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 
633 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.22 
 
 
1018 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5256  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.77 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.973302  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  26.32 
 
 
1012 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  29.28 
 
 
381 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.21 
 
 
484 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03360  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13770)  31.32 
 
 
463 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.01 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.74 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.88 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>