More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2482 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 341 aa  664    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  80.48 
 
 		 339 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  71.47 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  71.77 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  70.21 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  71.43 
 
 		 351 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.73 
 
 		 341 aa  408  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.25 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.66 
 
 		 341 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  58.38 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.36 
 
 		 342 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  58.26 
 
 		 338 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.06 
 
 		 341 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.53 
 
 		 341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.71 
 
 		 338 aa  351  8.999999999999999e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.54 
 
 		 339 aa  347  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.93 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.76 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.88 
 
 		 337 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.69 
 
 		 344 aa  318  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.5 
 
 		 339 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  52.83 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.89 
 
 		 337 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  51.82 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.45 
 
 		 308 aa  295  8e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  56.42 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  50.62 
 
 		 328 aa  286  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.34 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.85 
 
 		 338 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.53 
 
 		 338 aa  269  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.65 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.4 
 
 		 337 aa  255  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  54.84 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.76 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.72 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.78 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.13 
 
 		 340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.17 
 
 		 340 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.5 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.82 
 
 		 364 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  38.31 
 
 		 344 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.36 
 
 		 387 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.36 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.76 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  42.61 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.7 
 
 		 478 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  38.03 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  37.89 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  37.89 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  37.89 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  37.89 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  37.89 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.54 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  37.19 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  37.19 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  37.19 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.13 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  37.19 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  37.54 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.54 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  39.15 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  37.19 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  37.19 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.31 
 
 		 511 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  37.19 
 
 		 341 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  40.83 
 
 		 365 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.58 
 
 		 511 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  38.38 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  38.79 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.22 
 
 		 353 aa  159  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  36.43 
 
 		 517 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 		 361 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  39.24 
 
 		 336 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  39.18 
 
 		 327 aa  159  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  36.52 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  38.08 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.39 
 
 		 363 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  37.72 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  39.5 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.81 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  38.08 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  39.5 
 
 		 356 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  38.99 
 
 		 341 aa  155  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  37.37 
 
 		 336 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  36.52 
 
 		 348 aa  155  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  40.86 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  37.19 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  37.41 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  33.77 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  35.93 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  33.77 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  33.77 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  37.41 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  37.72 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  35.56 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  35.63 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1525  beta-hexosaminidase  38.28 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.276065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  35.46 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>