More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1586 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 337 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  97.33 
 
 		 337 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  81.07 
 
 		 338 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.18 
 
 		 328 aa  335  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.14 
 
 		 353 aa  332  7.000000000000001e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.96 
 
 		 338 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  53.99 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  53.13 
 
 		 342 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.94 
 
 		 341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.05 
 
 		 341 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.56 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.11 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.49 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.15 
 
 		 337 aa  298  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.02 
 
 		 342 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.65 
 
 		 343 aa  288  9e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.33 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.89 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.65 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  52.06 
 
 		 343 aa  279  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.79 
 
 		 334 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.34 
 
 		 339 aa  278  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  51.8 
 
 		 338 aa  278  8e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.02 
 
 		 339 aa  278  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.38 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.76 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.24 
 
 		 337 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.02 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.27 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  46.25 
 
 		 337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  43.94 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  50.51 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.81 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.46 
 
 		 308 aa  239  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.45 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.34 
 
 		 337 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.95 
 
 		 355 aa  222  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.36 
 
 		 340 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.42 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.55 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.38 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.87 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  39.56 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.06 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  37.5 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  37.24 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  36.59 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  33.92 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.44 
 
 		 528 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  36.93 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  36.11 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  36.24 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  36.33 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  34.53 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  36.79 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  36.11 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  35.76 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  33.94 
 
 		 517 aa  143  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  34.88 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32 
 
 		 363 aa  142  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.81 
 
 		 348 aa  142  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  38.59 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  35.42 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  37.28 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  32.51 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  35.76 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  34.46 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  35.59 
 
 		 341 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  36.24 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  36.92 
 
 		 356 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  33.45 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  33.1 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.51 
 
 		 511 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.94 
 
 		 362 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  34.26 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  34.84 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  33.22 
 
 		 341 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.22 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.36 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  35.23 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.74 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  32.87 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  32.87 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  36.54 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  32.87 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  33.22 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  38.35 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.48 
 
 		 511 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  32.87 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  32.87 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  32.86 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  32.86 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  32.86 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  32.86 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  32.86 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  32.86 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  34.9 
 
 		 381 aa  132  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  32.87 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  30.27 
 
 		 528 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  36.73 
 
 		 360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>