More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1682 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 337 aa  683    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  92.88 
 
 		 337 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  68.75 
 
 		 344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  64.69 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.58 
 
 		 339 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  61.83 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  56.21 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  56.21 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.45 
 
 		 341 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.14 
 
 		 341 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.87 
 
 		 341 aa  341  8e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  53.15 
 
 		 338 aa  341  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.42 
 
 		 341 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  52.87 
 
 		 342 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.65 
 
 		 339 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.78 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.01 
 
 		 343 aa  328  9e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.94 
 
 		 342 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.3 
 
 		 343 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.05 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.12 
 
 		 351 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.49 
 
 		 338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.8 
 
 		 334 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.43 
 
 		 337 aa  312  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  50 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.36 
 
 		 341 aa  298  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.19 
 
 		 335 aa  288  6e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.24 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.52 
 
 		 338 aa  272  7e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.6 
 
 		 355 aa  255  9e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.03 
 
 		 328 aa  245  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.63 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.33 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  46 
 
 		 308 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.31 
 
 		 337 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.76 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  49.31 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.46 
 
 		 340 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.44 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.4 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.05 
 
 		 364 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.54 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.71 
 
 		 511 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  36.77 
 
 		 344 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.22 
 
 		 511 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.44 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  38.11 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.18 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.39 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  36.62 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.06 
 
 		 426 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  32.83 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  36.4 
 
 		 360 aa  155  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  32.83 
 
 		 341 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  37.46 
 
 		 365 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  34.42 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  34.42 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  34.42 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  34.42 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  34.42 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  35.21 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  34.3 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  34.67 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  32.22 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  32.22 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  33.77 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  32.22 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  32.52 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  32.22 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  32.22 
 
 		 341 aa  152  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  36.93 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.22 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  36.04 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  37.08 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  34.09 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  35.16 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.59 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  34.67 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  34.98 
 
 		 336 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  34.28 
 
 		 517 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  33.63 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  34.51 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  32.85 
 
 		 349 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  35.96 
 
 		 381 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.98 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  35.09 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  34.22 
 
 		 365 aa  149  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 		 347 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  35.59 
 
 		 349 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  33.45 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  32.79 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  34.74 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  34.02 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  36.47 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  35.59 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  33.65 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.75 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>