More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1091 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
355 aa  708    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  67.66 
 
 
335 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.05 
 
 
337 aa  332  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.09 
 
 
341 aa  295  8e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.17 
 
 
341 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  50 
 
 
342 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.05 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.06 
 
 
338 aa  282  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.07 
 
 
334 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.53 
 
 
342 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.39 
 
 
337 aa  276  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.15 
 
 
341 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.38 
 
 
339 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.14 
 
 
337 aa  275  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.83 
 
 
337 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.6 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  47.8 
 
 
338 aa  268  8e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.68 
 
 
339 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  51 
 
 
343 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.86 
 
 
341 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.38 
 
 
351 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.33 
 
 
308 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  50 
 
 
343 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  47.21 
 
 
337 aa  260  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  47.21 
 
 
339 aa  260  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  47.68 
 
 
343 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  49.03 
 
 
328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.23 
 
 
339 aa  255  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.42 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.37 
 
 
344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.43 
 
 
308 aa  235  9e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  46.88 
 
 
338 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.25 
 
 
328 aa  215  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.78 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.13 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.91 
 
 
338 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.39 
 
 
337 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.28 
 
 
353 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  50 
 
 
337 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.66 
 
 
340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.54 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.13 
 
 
511 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  39.37 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  36.03 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  36.03 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.3 
 
 
365 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.91 
 
 
365 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.99 
 
 
348 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  42.53 
 
 
365 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.28 
 
 
528 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.77 
 
 
347 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  35.92 
 
 
344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  35.31 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  36.71 
 
 
359 aa  153  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  37.06 
 
 
349 aa  153  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.46 
 
 
346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.28 
 
 
362 aa  152  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 
361 aa  152  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.19 
 
 
490 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  36.59 
 
 
381 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  37.94 
 
 
342 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  37.94 
 
 
342 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  37.94 
 
 
342 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  37.94 
 
 
342 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  37.94 
 
 
342 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  37.94 
 
 
342 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  37.94 
 
 
342 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.04 
 
 
426 aa  149  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  35.17 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  34.42 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  35.56 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  35.78 
 
 
342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.01 
 
 
387 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  36.34 
 
 
350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  36.93 
 
 
342 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  36.93 
 
 
342 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  35.6 
 
 
349 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  34.71 
 
 
342 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  36.1 
 
 
349 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  34.6 
 
 
342 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  37.87 
 
 
360 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  36.88 
 
 
347 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.11 
 
 
354 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  34.39 
 
 
342 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  36.52 
 
 
349 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  38.11 
 
 
354 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  37.28 
 
 
342 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  34.89 
 
 
357 aa  143  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1735  beta-hexosaminidase  37.94 
 
 
342 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0532306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  35.35 
 
 
342 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
341 aa  142  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  36.76 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  41.54 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  32.92 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.11 
 
 
478 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.64 
 
 
511 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.86 
 
 
343 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  33.77 
 
 
370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  31.23 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  31.23 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>