More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1777 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 339 aa  670    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.2 
 
 		 341 aa  358  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.26 
 
 		 339 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.78 
 
 		 343 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.78 
 
 		 343 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.68 
 
 		 338 aa  348  8e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  62.41 
 
 		 341 aa  345  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.88 
 
 		 351 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  58.94 
 
 		 342 aa  339  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.31 
 
 		 341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.41 
 
 		 334 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.62 
 
 		 341 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.08 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.55 
 
 		 342 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  57.34 
 
 		 338 aa  325  7e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.4 
 
 		 337 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.28 
 
 		 341 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.55 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  57.19 
 
 		 343 aa  312  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  50.15 
 
 		 337 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.13 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  51.59 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.24 
 
 		 337 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.29 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.95 
 
 		 308 aa  281  8.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.06 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.49 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  56 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  53.56 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.68 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.04 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  48.53 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.96 
 
 		 328 aa  255  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  55.09 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.59 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.52 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.04 
 
 		 337 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.59 
 
 		 340 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.83 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.03 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.28 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.91 
 
 		 347 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  40.85 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.71 
 
 		 365 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.58 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  41.3 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  39.86 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  39.86 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  39.86 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  39.86 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  39.86 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  39.37 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  39.65 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  39.65 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  39.37 
 
 		 350 aa  169  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  37.8 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  34.73 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  35.74 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1525  beta-hexosaminidase  37.76 
 
 		 335 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.276065  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  38.56 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1735  beta-hexosaminidase  39.51 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0532306  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.08 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.86 
 
 		 511 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  37.32 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  37.93 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.52 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  36.74 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  37.98 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.15 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  37.89 
 
 		 349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  36.62 
 
 		 313 aa  162  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  37.63 
 
 		 342 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  37.98 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  35.51 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  37.63 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  37.63 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  37.54 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.15 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  37.15 
 
 		 335 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  38.11 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  38.66 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01728  beta-hexosaminidase  37.54 
 
 		 361 aa  156  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.29 
 
 		 353 aa  155  8e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  36.14 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  35.37 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.22 
 
 		 363 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.42 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.42 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2247  beta-hexosaminidase  36.9 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  36.01 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  35.81 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.79 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  34.35 
 
 		 349 aa  153  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  35.05 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  36.27 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  35.71 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.52 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  37.54 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.05 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>