More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4411 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 337 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.47 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.78 
 
 		 342 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  62.42 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  60.53 
 
 		 342 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.64 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  61.92 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.55 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.78 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.93 
 
 		 334 aa  345  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.83 
 
 		 338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.62 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  58.23 
 
 		 343 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  57.62 
 
 		 339 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.74 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.47 
 
 		 343 aa  328  8e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.47 
 
 		 343 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  55.9 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.43 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.86 
 
 		 351 aa  322  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.4 
 
 		 339 aa  322  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.34 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.62 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  53.25 
 
 		 337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  50.45 
 
 		 339 aa  312  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.03 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  57.05 
 
 		 338 aa  295  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.63 
 
 		 335 aa  286  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.24 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.35 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.14 
 
 		 355 aa  269  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.62 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.55 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.75 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  56.79 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.5 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.07 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.44 
 
 		 337 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.48 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.48 
 
 		 340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.45 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  39.12 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  38.83 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.78 
 
 		 341 aa  179  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  38.78 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  38.44 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  38.44 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  38.44 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  38.44 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  38.44 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  38.44 
 
 		 341 aa  175  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  42.76 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  40.42 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  37.5 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.35 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  37.15 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  38.77 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  36.61 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  36.61 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  36.61 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  38.83 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  37.37 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  38.44 
 
 		 352 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  39.37 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  40.34 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  37.72 
 
 		 359 aa  159  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.86 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.59 
 
 		 528 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.86 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.65 
 
 		 362 aa  157  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.34 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.34 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  35.59 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  37.8 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.53 
 
 		 511 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  37.93 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  37.72 
 
 		 356 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  36.81 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  38.99 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  43.08 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  35.81 
 
 		 352 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  36.81 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  37.68 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  38.99 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.81 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  37.01 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  35.46 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  35.44 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  37.06 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.65 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  37.11 
 
 		 336 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  36.95 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  34.46 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  40.94 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>