More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3192 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 341 aa  673    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  83.58 
 
 		 341 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  79.77 
 
 		 341 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  77.71 
 
 		 342 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  78.57 
 
 		 342 aa  521  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  78.08 
 
 		 341 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  77.48 
 
 		 338 aa  494  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.93 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.49 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.93 
 
 		 334 aa  362  6e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  57.57 
 
 		 339 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.46 
 
 		 343 aa  359  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.88 
 
 		 351 aa  358  8e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.76 
 
 		 343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.69 
 
 		 337 aa  355  8.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.98 
 
 		 337 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.06 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.78 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  55.56 
 
 		 343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.89 
 
 		 338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.4 
 
 		 344 aa  325  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.15 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  50.76 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  50.15 
 
 		 339 aa  319  5e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.59 
 
 		 339 aa  316  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  55.09 
 
 		 338 aa  315  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.33 
 
 		 335 aa  293  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  48.79 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.57 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.81 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.83 
 
 		 338 aa  275  9e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  52 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.54 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  55.39 
 
 		 337 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.49 
 
 		 337 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.47 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.73 
 
 		 353 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.84 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.36 
 
 		 340 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.79 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.31 
 
 		 364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.58 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  37.03 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.08 
 
 		 511 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  36.04 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  33.63 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  35.29 
 
 		 363 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  37.94 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  36.04 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.21 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.26 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  34.63 
 
 		 517 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.14 
 
 		 365 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  39.32 
 
 		 365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.11 
 
 		 365 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.81 
 
 		 346 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  34.97 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.04 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  34.8 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  35.57 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  34.48 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  35.44 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.57 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  34.48 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2034  beta-hexosaminidase  35.26 
 
 		 339 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.362016  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  34.48 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  34.48 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  34.48 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  34.48 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  33.82 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  35.09 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  34.55 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 361 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  34.55 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  34.55 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  34.55 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  34.55 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.18 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  34.58 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  35.19 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  36.49 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  36.2 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  33.92 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  34.39 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  32.15 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  34.24 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.36 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  34.62 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  34.52 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  39.08 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  35.79 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  35 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  35 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  39.07 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  31.83 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  35.79 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  31.38 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  35 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  34.39 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  35 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>