More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1760 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 341 aa  683    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  87.28 
 
 		 338 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  80.43 
 
 		 341 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  77.13 
 
 		 341 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  78.08 
 
 		 341 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  73.9 
 
 		 342 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  74.77 
 
 		 342 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.8 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.93 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.63 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.66 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.14 
 
 		 351 aa  364  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.36 
 
 		 343 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.12 
 
 		 341 aa  362  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.45 
 
 		 337 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.06 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  58.73 
 
 		 343 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.24 
 
 		 344 aa  348  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.66 
 
 		 341 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.09 
 
 		 337 aa  342  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.61 
 
 		 339 aa  341  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  52.42 
 
 		 339 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  52.73 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  55.15 
 
 		 338 aa  329  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.31 
 
 		 339 aa  325  7e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.64 
 
 		 338 aa  315  6e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  49.25 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.83 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.62 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.67 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.15 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.23 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.2 
 
 		 353 aa  256  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  50 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.17 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  51.92 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.62 
 
 		 337 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.57 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.58 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.81 
 
 		 308 aa  237  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  37 
 
 		 364 aa  206  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  38.19 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.54 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  38.13 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  37.77 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.23 
 
 		 511 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.13 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  34.76 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  34.66 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  37.63 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  37.77 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  37.77 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  37.77 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  37.77 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  37.63 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  37.15 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  35.34 
 
 		 517 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.07 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  36.92 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.08 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  36.92 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 		 478 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  36.07 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.46 
 
 		 511 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  35.2 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.07 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  35.25 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  34.48 
 
 		 359 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  32.62 
 
 		 349 aa  153  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  33.44 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  37.99 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.47 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  36.36 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.98 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  33.79 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  37.1 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  34.85 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.6 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  36.36 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  35.71 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.57 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  36.24 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.57 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.4 
 
 		 363 aa  149  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.09 
 
 		 364 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  35.71 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  35.71 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  36.4 
 
 		 336 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  35.53 
 
 		 336 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.87 
 
 		 365 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  36.3 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  34.77 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  38.31 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  34.29 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>