More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6683 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 340 aa  690    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  91.18 
 
 		 340 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.37 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.9 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.53 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.53 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.58 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.18 
 
 		 341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.53 
 
 		 351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.59 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.26 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.35 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  40.74 
 
 		 342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.67 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 338 aa  226  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.96 
 
 		 337 aa  226  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.31 
 
 		 341 aa  225  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.16 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.59 
 
 		 342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  42.3 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  39.51 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.46 
 
 		 337 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.58 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.91 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.48 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.32 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  42.66 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  39.3 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  39.3 
 
 		 339 aa  202  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.7 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.54 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.04 
 
 		 344 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  43 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.01 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.66 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.82 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.56 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.36 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.43 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  41.07 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.34 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  35.23 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.8 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.1 
 
 		 528 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  34.52 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0119  glycoside hydrolase family 3 protein  38.1 
 
 		 467 aa  125  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0117  glycoside hydrolase family 3 protein  37.66 
 
 		 465 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  30.45 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.57 
 
 		 511 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  32.14 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  34.92 
 
 		 382 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.92 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.49 
 
 		 698 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  29.66 
 
 		 520 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  32.03 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  32.04 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  30.69 
 
 		 517 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  35.43 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  36 
 
 		 541 aa  119  7.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  31.79 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  33.57 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  31.67 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  33.33 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  32.95 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  33.74 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  30.71 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  33.72 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  30.56 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  27.73 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  32.95 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  32.17 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  32.17 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  32.95 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.41 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  32.17 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  33.22 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  32.17 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  32.95 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  32.17 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.95 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  32.95 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  32.95 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  31.07 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  28.37 
 
 		 363 aa  116  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  32.03 
 
 		 342 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  31.82 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.69 
 
 		 365 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.31 
 
 		 382 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  32.98 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.04 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  32.95 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1132  beta-hexosaminidase  30.5 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00323913  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  33.81 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  31.07 
 
 		 342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 633 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.14 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  32.04 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  31.12 
 
 		 342 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>