More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2673 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  100 
 
 		 338 aa  688    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  64.69 
 
 		 337 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  65.88 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.76 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  55.52 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  55.82 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.52 
 
 		 339 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  60.19 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.15 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.63 
 
 		 341 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.37 
 
 		 341 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  54.68 
 
 		 342 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.33 
 
 		 342 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.29 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  53.29 
 
 		 338 aa  330  3e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.47 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.85 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.85 
 
 		 343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.52 
 
 		 337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.67 
 
 		 334 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.18 
 
 		 343 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.03 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.52 
 
 		 351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.95 
 
 		 338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.71 
 
 		 341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.13 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.6 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  49.18 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.29 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.87 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.51 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.44 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.44 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.29 
 
 		 338 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.48 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.35 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.18 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  49.29 
 
 		 337 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.78 
 
 		 337 aa  215  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.43 
 
 		 353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.28 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  37.03 
 
 		 381 aa  155  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.54 
 
 		 348 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  36.27 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  36.27 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  35.34 
 
 		 344 aa  149  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.14 
 
 		 478 aa  149  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.11 
 
 		 511 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.33 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.45 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  37.98 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  33.65 
 
 		 511 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.25 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  35.44 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  36.77 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  36.11 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  34.91 
 
 		 357 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  41.38 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.4 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.63 
 
 		 347 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  34.86 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  37.28 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  38.64 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  37.28 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  38.17 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  37.28 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.28 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  37.76 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  39.39 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  35.69 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  35.31 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1525  beta-hexosaminidase  35.92 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.276065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  34.74 
 
 		 359 aa  139  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  30.48 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  35.76 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  36.93 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  36.93 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  36.93 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  36.93 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.05 
 
 		 528 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  34.49 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  35.42 
 
 		 335 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  31.25 
 
 		 363 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  35.56 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  36.93 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  32.75 
 
 		 517 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  36.69 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  36.3 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  36.59 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  34.15 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  33.44 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.42 
 
 		 346 aa  136  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  34.15 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  36.59 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  36.59 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  36.59 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  36.59 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  33.56 
 
 		 352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  32.62 
 
 		 313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  37.68 
 
 		 354 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>