More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1160 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 344 aa  699    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  68.75 
 
 		 337 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  67.36 
 
 		 337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  62.09 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.46 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  57.61 
 
 		 337 aa  391  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  57.31 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  59.76 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.24 
 
 		 341 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.25 
 
 		 342 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.75 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  54.35 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  52.87 
 
 		 342 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.68 
 
 		 341 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.61 
 
 		 341 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  58 
 
 		 334 aa  335  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  55.67 
 
 		 339 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.4 
 
 		 341 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.73 
 
 		 337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.71 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.99 
 
 		 343 aa  322  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.11 
 
 		 351 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.8 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.18 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  46.97 
 
 		 328 aa  295  9e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.43 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.06 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.62 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.99 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.42 
 
 		 328 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.37 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.83 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.91 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.66 
 
 		 338 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.79 
 
 		 337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.43 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.75 
 
 		 364 aa  212  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.64 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.88 
 
 		 337 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.04 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  46.88 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  38.36 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.36 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.36 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  38.91 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 341 aa  162  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.55 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.34 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  38.13 
 
 		 520 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.61 
 
 		 511 aa  155  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  35 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  35.51 
 
 		 336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.54 
 
 		 528 aa  153  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.14 
 
 		 511 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.69 
 
 		 348 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  35.51 
 
 		 336 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  36.96 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  34.75 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  37.09 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  35.14 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  34.19 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  36.59 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  34.78 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  32.73 
 
 		 349 aa  149  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  33.44 
 
 		 517 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  33.68 
 
 		 356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  36.36 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  35.51 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  34.3 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  34.49 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  34.95 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  32.8 
 
 		 344 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.12 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  37.59 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.25 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  33.45 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  35.02 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01728  beta-hexosaminidase  33.22 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  38.49 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  33.22 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.77 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  34.06 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  35.36 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  32.53 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  32.53 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  33.57 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  32.53 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  32.53 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  32.53 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.56 
 
 		 698 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  37.05 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  32.53 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  32.53 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  33.44 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  33.57 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  32.34 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  33.57 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  34.89 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>