More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0904 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 338 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  82.84 
 
 		 337 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  81.07 
 
 		 337 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  54.91 
 
 		 328 aa  338  7e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.98 
 
 		 338 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.52 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.57 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.96 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.87 
 
 		 343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  51.49 
 
 		 342 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.6 
 
 		 337 aa  305  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.24 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.6 
 
 		 337 aa  298  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.56 
 
 		 341 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.24 
 
 		 351 aa  295  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.45 
 
 		 341 aa  295  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.54 
 
 		 341 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  55.21 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.81 
 
 		 341 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.27 
 
 		 334 aa  288  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.63 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.14 
 
 		 341 aa  286  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.7 
 
 		 342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.5 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  51.67 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  48.45 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.1 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.15 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  49.66 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.69 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  45.48 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.34 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.99 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  50 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  46.39 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.95 
 
 		 337 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.73 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.24 
 
 		 340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.43 
 
 		 340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.42 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.09 
 
 		 365 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.77 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  41.46 
 
 		 365 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.23 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  40.71 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  38.54 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  38.19 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  38.75 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  38.06 
 
 		 336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  37.15 
 
 		 336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  38.41 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  37.94 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.07 
 
 		 511 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  35.55 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  37.81 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  41.07 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  36.46 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  37.46 
 
 		 356 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  33.88 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.22 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  35.41 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  37.7 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  31.7 
 
 		 363 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  34.58 
 
 		 313 aa  143  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.35 
 
 		 528 aa  142  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  36.25 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  35.56 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  34.24 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  33.57 
 
 		 517 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.33 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  35.81 
 
 		 359 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.62 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  36.92 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.03 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  35.22 
 
 		 347 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.48 
 
 		 511 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  38.04 
 
 		 360 aa  135  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.58 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  34.56 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  38.04 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.06 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  38.06 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  35.61 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.1 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  35.99 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  38.04 
 
 		 604 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.88 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  39.08 
 
 		 492 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  32.3 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.58 
 
 		 478 aa  132  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  38.52 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.67 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.6 
 
 		 558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  30.32 
 
 		 528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  33.8 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  33.8 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  33.8 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  32.69 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  33.8 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>