More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2510 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 342 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  78.89 
 
 		 341 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  78.11 
 
 		 342 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  77.71 
 
 		 341 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  77.13 
 
 		 341 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  74.77 
 
 		 341 aa  500  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  75.38 
 
 		 338 aa  481  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.8 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.14 
 
 		 334 aa  348  9e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.62 
 
 		 351 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.42 
 
 		 343 aa  347  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.99 
 
 		 341 aa  346  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.9 
 
 		 339 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.42 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.33 
 
 		 337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.25 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.65 
 
 		 341 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.99 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  54.86 
 
 		 343 aa  332  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.94 
 
 		 337 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.04 
 
 		 339 aa  325  9e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  49.85 
 
 		 337 aa  316  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  49.55 
 
 		 339 aa  315  5e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.11 
 
 		 338 aa  315  6e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  57.14 
 
 		 338 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.31 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  50.45 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.38 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.23 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.15 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.53 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.32 
 
 		 338 aa  255  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.7 
 
 		 338 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.02 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  51.75 
 
 		 337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.02 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.9 
 
 		 353 aa  232  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.25 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.78 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.59 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.94 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  38.35 
 
 		 341 aa  175  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  36.49 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  37.25 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  37.25 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.25 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.96 
 
 		 511 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  36.91 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.37 
 
 		 347 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  38.06 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  36.91 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  36.91 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  36.91 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  36.91 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  36.91 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  36.58 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  35.21 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  33.63 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.42 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  37.19 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  35.89 
 
 		 336 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.98 
 
 		 528 aa  159  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  36.84 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  35.22 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  35.22 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  35.22 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  35.22 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  35.22 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  35.11 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  35.11 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  34.81 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  35.11 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.84 
 
 		 348 aa  156  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  36.24 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  35.87 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  35.87 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  35.87 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.04 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  35.87 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  35.87 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  35.87 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  35.87 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  35.79 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  34.6 
 
 		 517 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  33.63 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  35.54 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  36.92 
 
 		 347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  35.29 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  35.79 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  35.62 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  33.33 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  38.57 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.01 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.79 
 
 		 363 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  35.62 
 
 		 356 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  33.33 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.01 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  37.29 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  36.01 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  35.28 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>