More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3398 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  97.96 
 
 		 343 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 343 aa  679    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  92.38 
 
 		 351 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  76.07 
 
 		 334 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  72.81 
 
 		 339 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  65.06 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  71.47 
 
 		 341 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.94 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.75 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.97 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  56.5 
 
 		 342 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  56.8 
 
 		 343 aa  361  8e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  56.68 
 
 		 338 aa  359  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.46 
 
 		 341 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.42 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.15 
 
 		 338 aa  350  3e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.7 
 
 		 339 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.01 
 
 		 337 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.71 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.71 
 
 		 344 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.4 
 
 		 337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.94 
 
 		 339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.01 
 
 		 337 aa  325  5e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  51.34 
 
 		 339 aa  325  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  51.34 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  54.98 
 
 		 338 aa  291  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.77 
 
 		 308 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  50.16 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.1 
 
 		 335 aa  282  6.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.24 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.55 
 
 		 337 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.48 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.12 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.84 
 
 		 355 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  56.12 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.14 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.83 
 
 		 353 aa  245  6e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.14 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.68 
 
 		 337 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.46 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.94 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  40.33 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.4 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.87 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.52 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.65 
 
 		 426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.74 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.47 
 
 		 478 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.8 
 
 		 511 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.5 
 
 		 511 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.59 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  35.34 
 
 		 363 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  41.18 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  37.24 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.7 
 
 		 387 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  35.14 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  39.22 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  37.15 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  37.38 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  37.5 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  31.61 
 
 		 517 aa  156  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  36.81 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  39.07 
 
 		 327 aa  156  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  38.87 
 
 		 332 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  35.49 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  34.74 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  34.56 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  35.56 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  35.56 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  35.56 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  35.56 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  35.56 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  35.56 
 
 		 348 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  37.32 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  36.62 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.79 
 
 		 528 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  33.63 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  35.74 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  36.55 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  34.51 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.15 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  33.53 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.52 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  36.14 
 
 		 360 aa  149  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  36.04 
 
 		 333 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  34.15 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  34.04 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  33.8 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  33.8 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  33.8 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  33.8 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.13 
 
 		 698 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  38.95 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  36.82 
 
 		 333 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  36.07 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  33.57 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  33.8 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  33.96 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  35.79 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>