More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1868 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
328 aa  641    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.93 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  54.43 
 
 
328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.99 
 
 
353 aa  296  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  50.45 
 
 
342 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  61.85 
 
 
337 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.61 
 
 
338 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  61.48 
 
 
337 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.3 
 
 
341 aa  292  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.73 
 
 
338 aa  288  8e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  51.27 
 
 
343 aa  282  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.68 
 
 
339 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.48 
 
 
337 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.2 
 
 
337 aa  275  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.62 
 
 
337 aa  275  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.79 
 
 
337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.15 
 
 
341 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.5 
 
 
343 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.11 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.55 
 
 
341 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.89 
 
 
341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.17 
 
 
334 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.78 
 
 
339 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  48.8 
 
 
338 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  47.4 
 
 
337 aa  265  8.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.04 
 
 
342 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.96 
 
 
339 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.35 
 
 
341 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  45.57 
 
 
339 aa  263  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.06 
 
 
344 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.48 
 
 
341 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.04 
 
 
351 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  47.32 
 
 
338 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.74 
 
 
308 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.13 
 
 
335 aa  216  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.67 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.8 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.41 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.98 
 
 
308 aa  196  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.39 
 
 
365 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.26 
 
 
340 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.39 
 
 
365 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  46.01 
 
 
365 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.26 
 
 
364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  39.14 
 
 
340 aa  165  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  42.59 
 
 
365 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  37.46 
 
 
327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.8 
 
 
511 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  36.79 
 
 
339 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  37.1 
 
 
327 aa  155  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  35.18 
 
 
341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  35.18 
 
 
341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  35.18 
 
 
341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  35.18 
 
 
341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.58 
 
 
490 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  35.18 
 
 
341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.07 
 
 
348 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  36.56 
 
 
336 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  35.71 
 
 
340 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  35.84 
 
 
336 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  34.32 
 
 
341 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  35.13 
 
 
331 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  34.32 
 
 
341 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  35.71 
 
 
343 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  35.71 
 
 
343 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  33.99 
 
 
341 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  35.02 
 
 
356 aa  149  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.32 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  35.12 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  35.69 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  34.32 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  35.84 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  36.66 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  33.99 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  36.1 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  33.99 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  33.99 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  33.99 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  33.99 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.18 
 
 
478 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  35.36 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  33.67 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.69 
 
 
528 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  35.54 
 
 
341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  35.87 
 
 
342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  35.94 
 
 
348 aa  145  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.24 
 
 
845 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  35.36 
 
 
342 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  35.48 
 
 
336 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.98 
 
 
361 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  33.74 
 
 
336 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.8 
 
 
511 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.45 
 
 
347 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  35 
 
 
342 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  35.59 
 
 
356 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  35.38 
 
 
357 aa  142  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.34 
 
 
387 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.04 
 
 
353 aa  142  7e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  34.29 
 
 
342 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.05 
 
 
346 aa  142  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>