More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08090 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_08090  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  100 
 
 
421 aa  811    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3777  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.49 
 
 
408 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0155235  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4513  glycoside hydrolase family 3 protein  36.54 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.662398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0385  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.56 
 
 
390 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0781  beta-glucosidase-like glycosidase  35.82 
 
 
392 aa  180  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0523  Beta-glucosidase-related glycosidase  30.9 
 
 
403 aa  176  9e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.328579  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0110  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.12 
 
 
418 aa  170  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.84 
 
 
426 aa  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  38.87 
 
 
335 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  26.78 
 
 
444 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  30.55 
 
 
374 aa  124  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.53 
 
 
392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.88 
 
 
543 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01720  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.62 
 
 
383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651137  normal  0.324393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01728  beta-hexosaminidase  35.29 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.21 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  29.15 
 
 
481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2332  Beta-N-acetylhexosaminidase  27 
 
 
409 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.6 
 
 
398 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.21 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  25.48 
 
 
382 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.73 
 
 
381 aa  113  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4457  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.72 
 
 
388 aa  113  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149935  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.45 
 
 
358 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.72 
 
 
596 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  29.15 
 
 
541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.22 
 
 
492 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  27.14 
 
 
351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  30.35 
 
 
382 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.67 
 
 
490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  30.64 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.26 
 
 
375 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  25.21 
 
 
382 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.77 
 
 
558 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.38 
 
 
395 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  26.1 
 
 
354 aa  109  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  28.78 
 
 
378 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.61 
 
 
379 aa  107  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  30.12 
 
 
631 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.69 
 
 
382 aa  106  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  33.46 
 
 
520 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.65 
 
 
543 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  35.56 
 
 
656 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  33.74 
 
 
349 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  31.52 
 
 
349 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  30.51 
 
 
517 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.62 
 
 
698 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.02 
 
 
484 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  26.45 
 
 
393 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  30.37 
 
 
511 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.74 
 
 
528 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.48 
 
 
511 aa  103  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  28.61 
 
 
990 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.89 
 
 
586 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 
386 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.42 
 
 
490 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  36.69 
 
 
335 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  32.43 
 
 
575 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  28.3 
 
 
427 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.93 
 
 
337 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.46 
 
 
403 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.63 
 
 
367 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  26.07 
 
 
520 aa  99.8  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  30.19 
 
 
420 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  30.11 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1525  beta-hexosaminidase  36.95 
 
 
335 aa  97.4  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.276065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  29.38 
 
 
966 aa  96.7  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.01 
 
 
341 aa  96.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  36.87 
 
 
499 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  25.49 
 
 
358 aa  96.3  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  28.97 
 
 
352 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  28.74 
 
 
557 aa  95.5  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  34.7 
 
 
575 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.33 
 
 
618 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10240  lipoprotein lpqI  30.32 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000940475  normal  0.839336 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  27.32 
 
 
395 aa  95.5  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  33.94 
 
 
542 aa  94.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.85 
 
 
354 aa  94  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
357 aa  94  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  30.85 
 
 
354 aa  94  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.46 
 
 
594 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 
633 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  31.56 
 
 
342 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.76 
 
 
339 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  31.39 
 
 
349 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  29.03 
 
 
370 aa  92.8  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  32.2 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  25.21 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.58 
 
 
343 aa  92  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.06 
 
 
373 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  25.51 
 
 
845 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  31.34 
 
 
537 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.19 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  30.49 
 
 
352 aa  90.5  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  31.91 
 
 
342 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  21.68 
 
 
531 aa  90.5  6e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  31.9 
 
 
604 aa  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.94 
 
 
365 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.94 
 
 
365 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 
365 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>