More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2440 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 373 aa  769    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  63.28 
 
 		 375 aa  462  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  62.57 
 
 		 374 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  61.45 
 
 		 375 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.42 
 
 		 375 aa  421  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  58.48 
 
 		 378 aa  413  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.77 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.61 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  50.3 
 
 		 382 aa  345  7e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.65 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.7 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.12 
 
 		 395 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  46.78 
 
 		 393 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.35 
 
 		 379 aa  332  9e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  45.38 
 
 		 481 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.18 
 
 		 358 aa  288  8e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  39.95 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  39.95 
 
 		 382 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  43.6 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  39.66 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  40.11 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.21 
 
 		 586 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  39.5 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  38.57 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.45 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.12 
 
 		 618 aa  210  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  34.2 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.49 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.49 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  33.63 
 
 		 365 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.22 
 
 		 558 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  34.97 
 
 		 656 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.45 
 
 		 698 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  35.9 
 
 		 354 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.13 
 
 		 543 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  34.76 
 
 		 520 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  36.75 
 
 		 552 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  33.91 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.05 
 
 		 528 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  33.79 
 
 		 845 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.36 
 
 		 598 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.47 
 
 		 580 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.24 
 
 		 426 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.14 
 
 		 543 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  34.01 
 
 		 517 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.67 
 
 		 511 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.6 
 
 		 420 aa  179  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 		 633 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  34.06 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  35.77 
 
 		 688 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.86 
 
 		 484 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.89 
 
 		 596 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.78 
 
 		 600 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.31 
 
 		 492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  34.81 
 
 		 604 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 		 511 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.32 
 
 		 490 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  33.62 
 
 		 528 aa  169  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.82 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.04 
 
 		 482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  30.66 
 
 		 520 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.01 
 
 		 594 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  34.59 
 
 		 498 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  32.86 
 
 		 990 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  37.94 
 
 		 542 aa  162  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1007 aa  162  7e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.23 
 
 		 552 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.56 
 
 		 478 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  33.43 
 
 		 589 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  32.36 
 
 		 971 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  34.98 
 
 		 992 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.26 
 
 		 534 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.26 
 
 		 534 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.92 
 
 		 504 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.94 
 
 		 568 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.77 
 
 		 582 aa  159  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  32.16 
 
 		 503 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  33.82 
 
 		 499 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.12 
 
 		 345 aa  157  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  33.44 
 
 		 631 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  33.64 
 
 		 673 aa  155  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  35.95 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  30.66 
 
 		 734 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  30.56 
 
 		 699 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.67 
 
 		 1018 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.55 
 
 		 953 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.18 
 
 		 490 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  31.12 
 
 		 699 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.62 
 
 		 530 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  30.81 
 
 		 699 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  33.24 
 
 		 966 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  30.29 
 
 		 699 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4457  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.83 
 
 		 388 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149935  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  34.7 
 
 		 370 aa  149  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  30.95 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.69 
 
 		 1002 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  29.39 
 
 		 637 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.38 
 
 		 343 aa  145  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.18 
 
 		 573 aa  145  9e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  31.1 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>