More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0523 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0523  Beta-glucosidase-related glycosidase  100 
 
 
403 aa  824    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.328579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3777  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.16 
 
 
408 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0155235  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4513  glycoside hydrolase family 3 protein  41.57 
 
 
388 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.662398  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0110  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.04 
 
 
418 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0781  beta-glucosidase-like glycosidase  38.48 
 
 
392 aa  228  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0385  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.73 
 
 
390 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08090  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.9 
 
 
421 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.9 
 
 
395 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 
386 aa  146  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  32.23 
 
 
427 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.29 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.14 
 
 
543 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.85 
 
 
426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  30.28 
 
 
517 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.19 
 
 
392 aa  136  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.95 
 
 
698 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.63 
 
 
398 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  30.93 
 
 
631 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  30.4 
 
 
393 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  28 
 
 
481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.37 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  30.03 
 
 
656 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.45 
 
 
414 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0897745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  29.82 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.08 
 
 
358 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.62 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.25 
 
 
379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.49 
 
 
528 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.79 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  30.2 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  32.29 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.29 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  30.56 
 
 
365 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.75 
 
 
348 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  29.83 
 
 
378 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  28.05 
 
 
374 aa  123  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  28.61 
 
 
520 aa  123  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 
365 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  30.83 
 
 
575 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2332  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.13 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  32.5 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.98 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.19 
 
 
511 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  30.28 
 
 
575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.26 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  29.91 
 
 
541 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  28.45 
 
 
382 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.47 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1221  glycosy hydrolase family protein  27.17 
 
 
400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.47 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  31.11 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  33.21 
 
 
341 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  33.21 
 
 
341 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  33.21 
 
 
341 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  33.21 
 
 
341 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  33.21 
 
 
341 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  27.93 
 
 
382 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  30.28 
 
 
342 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.48 
 
 
594 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.27 
 
 
543 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.07 
 
 
1018 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.02 
 
 
618 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  32.84 
 
 
327 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  27.51 
 
 
845 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  32.17 
 
 
359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  26.93 
 
 
351 aa  116  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  31.01 
 
 
328 aa  117  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.64 
 
 
558 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  30.69 
 
 
342 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.46 
 
 
375 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.2 
 
 
583 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.85 
 
 
596 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  32.84 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  28.65 
 
 
997 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  30.94 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.24 
 
 
586 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  27.94 
 
 
557 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  30.81 
 
 
604 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  30.7 
 
 
971 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  30.31 
 
 
511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.75 
 
 
341 aa  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.25 
 
 
580 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.71 
 
 
403 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  31.67 
 
 
349 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  31.75 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  28.49 
 
 
375 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  31.75 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  31.75 
 
 
341 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  31.75 
 
 
341 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  27.93 
 
 
542 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  28.66 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  29.49 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.52 
 
 
976 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  30.61 
 
 
335 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  31.39 
 
 
341 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  33.46 
 
 
337 aa  110  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  30.15 
 
 
347 aa  109  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  31.63 
 
 
552 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  30.21 
 
 
990 aa  109  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>