More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2928 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
382 aa  773    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.2 
 
 
398 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.15 
 
 
392 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.65 
 
 
373 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  50 
 
 
375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  49.55 
 
 
378 aa  334  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  45.74 
 
 
375 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  49.7 
 
 
374 aa  333  4e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.11 
 
 
373 aa  327  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.81 
 
 
375 aa  326  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  48.02 
 
 
481 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.37 
 
 
586 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.47 
 
 
379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  45.54 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.18 
 
 
395 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  43.77 
 
 
382 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.61 
 
 
358 aa  296  5e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  42.3 
 
 
382 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  41.74 
 
 
382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  41.33 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  39.49 
 
 
358 aa  254  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  38.81 
 
 
358 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  36.14 
 
 
351 aa  206  7e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  39.94 
 
 
365 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.64 
 
 
365 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.64 
 
 
365 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  35.92 
 
 
444 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.54 
 
 
528 aa  203  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  39.94 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.58 
 
 
511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  35.73 
 
 
517 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.31 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  34.36 
 
 
350 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  41.42 
 
 
656 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.85 
 
 
698 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  40.63 
 
 
498 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.05 
 
 
387 aa  192  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.69 
 
 
618 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  35.73 
 
 
520 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  30.92 
 
 
354 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.73 
 
 
594 aa  185  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  30.9 
 
 
845 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  40.41 
 
 
503 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.77 
 
 
534 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.77 
 
 
534 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  35.16 
 
 
427 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  32.49 
 
 
673 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.57 
 
 
558 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.01 
 
 
426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.94 
 
 
484 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.98 
 
 
543 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.25 
 
 
537 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.14 
 
 
543 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  35.56 
 
 
604 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.04 
 
 
598 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  36.83 
 
 
520 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  38.87 
 
 
499 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.34 
 
 
580 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.38 
 
 
478 aa  173  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01720  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.58 
 
 
383 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651137  normal  0.324393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.02 
 
 
492 aa  170  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  35.8 
 
 
552 aa  169  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  36.16 
 
 
542 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  36.96 
 
 
575 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  34.15 
 
 
688 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  33.96 
 
 
734 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.96 
 
 
504 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.87 
 
 
543 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 
511 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.01 
 
 
345 aa  166  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  34.84 
 
 
575 aa  166  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.71 
 
 
600 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  34.22 
 
 
633 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.46 
 
 
482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.22 
 
 
552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.29 
 
 
596 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.14 
 
 
976 aa  163  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.79 
 
 
490 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  38.12 
 
 
631 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  35.63 
 
 
386 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  35.67 
 
 
420 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  34.8 
 
 
370 aa  160  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  31.64 
 
 
363 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.11 
 
 
490 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 
361 aa  156  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  33.43 
 
 
990 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  35.53 
 
 
966 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  37.25 
 
 
538 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.15 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10240  lipoprotein lpqI  34.2 
 
 
388 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000940475  normal  0.839336 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  30 
 
 
528 aa  153  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  34.05 
 
 
992 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 
557 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  34.15 
 
 
971 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0219  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.9 
 
 
397 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.98 
 
 
568 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0117  glycoside hydrolase family 3 protein  31.77 
 
 
465 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0415  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.18 
 
 
328 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0119  glycoside hydrolase family 3 protein  31.77 
 
 
467 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  31.59 
 
 
1007 aa  150  4e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>