More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1318 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  100 
 
 		 382 aa  776    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  53.43 
 
 		 393 aa  368  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.23 
 
 		 375 aa  355  5e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.12 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.3 
 
 		 373 aa  345  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  50.3 
 
 		 374 aa  338  9e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  47.93 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.91 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.99 
 
 		 375 aa  327  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.66 
 
 		 379 aa  326  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.01 
 
 		 373 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  47.46 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.77 
 
 		 382 aa  300  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  42.93 
 
 		 481 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.43 
 
 		 398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  43.2 
 
 		 395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.47 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  39.58 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  38.79 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.98 
 
 		 586 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0916  hypothetical protein  39.42 
 
 		 358 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0946  hypothetical protein  39.53 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  37.54 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  38.44 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.22 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.44 
 
 		 365 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.14 
 
 		 365 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 		 543 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  35.33 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.83 
 
 		 426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  35.06 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  33.62 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.49 
 
 		 618 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.57 
 
 		 698 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.87 
 
 		 594 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  35.89 
 
 		 503 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.9 
 
 		 528 aa  179  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  33.63 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.22 
 
 		 492 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  34.59 
 
 		 656 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.53 
 
 		 482 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.07 
 
 		 543 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.06 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  33.63 
 
 		 511 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.17 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.45 
 
 		 598 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  35.85 
 
 		 604 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.95 
 
 		 845 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  34.11 
 
 		 631 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.72 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  37.13 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.01 
 
 		 361 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.83 
 
 		 953 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.67 
 
 		 558 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.95 
 
 		 552 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  35.4 
 
 		 370 aa  166  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  35.65 
 
 		 520 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.84 
 
 		 511 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  32.84 
 
 		 528 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 		 633 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  35.24 
 
 		 552 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  32.94 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.99 
 
 		 478 aa  163  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.46 
 
 		 534 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.46 
 
 		 534 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.54 
 
 		 600 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.28 
 
 		 580 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.84 
 
 		 363 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.48 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  31.83 
 
 		 688 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.23 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.14 
 
 		 976 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.54 
 
 		 596 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.52 
 
 		 537 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  35.67 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.51 
 
 		 504 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  34.86 
 
 		 673 aa  156  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  31.87 
 
 		 997 aa  155  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  31.49 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  30.43 
 
 		 517 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.37 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  32.01 
 
 		 990 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.6 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.49 
 
 		 1018 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.34 
 
 		 530 aa  153  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  35 
 
 		 499 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2567  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.79 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.946372  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  42.99 
 
 		 475 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  35.76 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.57 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.89 
 
 		 568 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.75 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0117  glycoside hydrolase family 3 protein  28.7 
 
 		 465 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  32.8 
 
 		 971 aa  150  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1007 aa  150  5e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  34.05 
 
 		 575 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0119  glycoside hydrolase family 3 protein  28.28 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.79 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  32.13 
 
 		 699 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>