More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2523 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
337 aa  693    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  35.58 
 
 
520 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.34 
 
 
511 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.47 
 
 
511 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.46 
 
 
343 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.19 
 
 
698 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  33.69 
 
 
517 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.28 
 
 
365 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.93 
 
 
365 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.89 
 
 
353 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  38.43 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  39.65 
 
 
365 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.72 
 
 
528 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.43 
 
 
364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.47 
 
 
358 aa  162  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.9 
 
 
379 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.13 
 
 
426 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  36.53 
 
 
604 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.39 
 
 
594 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  30.03 
 
 
361 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  29.64 
 
 
363 aa  156  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.49 
 
 
503 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  35.13 
 
 
520 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  32.57 
 
 
370 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 
633 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.97 
 
 
420 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.7 
 
 
543 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1990  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.58 
 
 
372 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.639682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  32.19 
 
 
427 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  35.59 
 
 
552 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.13 
 
 
492 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  32.99 
 
 
673 aa  150  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  33.23 
 
 
498 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.1 
 
 
490 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.05 
 
 
346 aa  149  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  34.34 
 
 
349 aa  149  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  32.76 
 
 
375 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  33.54 
 
 
499 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.28 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  32.87 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  34.57 
 
 
990 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.04 
 
 
618 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.52 
 
 
484 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.31 
 
 
600 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.41 
 
 
504 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  30.03 
 
 
845 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  33.22 
 
 
313 aa  145  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.79 
 
 
348 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.81 
 
 
558 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  31.85 
 
 
359 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  31.36 
 
 
699 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  31.36 
 
 
699 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  30.77 
 
 
699 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.11 
 
 
398 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  32.28 
 
 
357 aa  142  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  31.56 
 
 
341 aa  142  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.77 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  34.77 
 
 
378 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  33.23 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  33.45 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  33.45 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.87 
 
 
543 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  33.45 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  33.45 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.74 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.15 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  33.45 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 
374 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  33.33 
 
 
966 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  30 
 
 
699 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  36.33 
 
 
541 aa  140  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.22 
 
 
343 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  35.8 
 
 
1012 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  33.1 
 
 
337 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.65 
 
 
339 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.65 
 
 
362 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  30.16 
 
 
395 aa  139  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  33.94 
 
 
1007 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.99 
 
 
375 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  33 
 
 
347 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 
393 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  32.75 
 
 
341 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  33.23 
 
 
336 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.25 
 
 
375 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  33.57 
 
 
336 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.86 
 
 
351 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.51 
 
 
343 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  32.53 
 
 
354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.53 
 
 
354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.97 
 
 
596 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  32.86 
 
 
336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.57 
 
 
367 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  33.57 
 
 
336 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  33.6 
 
 
557 aa  135  7.000000000000001e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2290  glycoside hydrolase family 3 protein  31.63 
 
 
429 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.2 
 
 
308 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  34.73 
 
 
337 aa  135  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  29.85 
 
 
656 aa  135  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  34.3 
 
 
631 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  31.1 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>