More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2290 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2290  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 429 aa  858    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4322  putative Beta-hexosaminidase  46.57 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.44 
 
 		 528 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.93 
 
 		 698 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.7 
 
 		 845 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.63 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  31.54 
 
 		 517 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  33.14 
 
 		 604 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  35.94 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.46 
 
 		 392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  34.04 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  33.24 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  31.35 
 
 		 520 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.14 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.83 
 
 		 365 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  34.17 
 
 		 336 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.93 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  34.88 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  33.81 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  35.23 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  34.95 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.64 
 
 		 420 aa  123  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.91 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.27 
 
 		 534 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.5 
 
 		 343 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.27 
 
 		 534 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  27.09 
 
 		 351 aa  123  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  30.16 
 
 		 361 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  32 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  31.05 
 
 		 557 aa  121  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.56 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  34.52 
 
 		 336 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  34.8 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  34.52 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  34.52 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2600  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.1 
 
 		 575 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  33.8 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  28.66 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  30.19 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.79 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  34.8 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4457  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.43 
 
 		 388 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  34.16 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.12 
 
 		 596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  33.45 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  31.96 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.77 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  33.63 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2890  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.74 
 
 		 553 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.31 
 
 		 618 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.48 
 
 		 353 aa  117  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.63 
 
 		 375 aa  117  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.67 
 
 		 511 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  27.91 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  33.1 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  36.12 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  33.69 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  33.1 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  30.45 
 
 		 589 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.66 
 
 		 580 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.09 
 
 		 339 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  31.55 
 
 		 631 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  30.39 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  31.89 
 
 		 337 aa  113  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  35.64 
 
 		 335 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.48 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.78 
 
 		 600 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.4 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  32.48 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  32.37 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  28.93 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  30.8 
 
 		 528 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.52 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.48 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  31.63 
 
 		 327 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.48 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  29.97 
 
 		 492 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  30.72 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.66 
 
 		 543 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.1 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  30.18 
 
 		 343 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.48 
 
 		 343 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  30.18 
 
 		 343 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  32.05 
 
 		 520 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  30.67 
 
 		 342 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  30.67 
 
 		 342 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0119  glycoside hydrolase family 3 protein  27.99 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  30.67 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  30.67 
 
 		 342 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.59 
 
 		 339 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.16 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  30.67 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  30.67 
 
 		 342 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  24.63 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4513  glycoside hydrolase family 3 protein  35.29 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.662398  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.21 
 
 		 341 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>