More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2499 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  69.68 
 
 		 582 aa  793    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  68.82 
 
 		 591 aa  802    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 589 aa  1203    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  53.4 
 
 		 592 aa  620  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.89 
 
 		 583 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  50.77 
 
 		 585 aa  587  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.29 
 
 		 573 aa  571  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  41.26 
 
 		 966 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  34.86 
 
 		 624 aa  320  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.21 
 
 		 596 aa  312  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 1018 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  31.32 
 
 		 990 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.78 
 
 		 698 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  34.22 
 
 		 604 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.71 
 
 		 953 aa  294  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.34 
 
 		 600 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  30.12 
 
 		 997 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  33.21 
 
 		 992 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.84 
 
 		 543 aa  282  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.91 
 
 		 976 aa  281  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1007 aa  278  2e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  32.77 
 
 		 971 aa  277  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  31.84 
 
 		 1012 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.16 
 
 		 568 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.47 
 
 		 558 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  31.09 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  33.27 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  34.58 
 
 		 1003 aa  263  4.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.7 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.05 
 
 		 618 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.54 
 
 		 534 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.54 
 
 		 534 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.9 
 
 		 528 aa  251  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  39.39 
 
 		 656 aa  243  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.8 
 
 		 1002 aa  239  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.42 
 
 		 580 aa  230  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  30.13 
 
 		 631 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  35.05 
 
 		 427 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.86 
 
 		 543 aa  225  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.2 
 
 		 552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.87 
 
 		 420 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  27.86 
 
 		 845 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  37.57 
 
 		 542 aa  216  7e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  37.34 
 
 		 538 aa  212  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.51 
 
 		 543 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  30.91 
 
 		 541 aa  209  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  26.55 
 
 		 586 aa  207  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.14 
 
 		 426 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  32.09 
 
 		 699 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  36.73 
 
 		 520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  31.86 
 
 		 699 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  35.03 
 
 		 444 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  30.06 
 
 		 538 aa  196  9e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  31.54 
 
 		 699 aa  196  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  31.86 
 
 		 699 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.63 
 
 		 511 aa  194  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  29.54 
 
 		 517 aa  194  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  38.38 
 
 		 492 aa  193  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  37.7 
 
 		 365 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.38 
 
 		 365 aa  190  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.38 
 
 		 365 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.35 
 
 		 594 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  41.83 
 
 		 498 aa  187  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  36.47 
 
 		 503 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.03 
 
 		 598 aa  186  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  39 
 
 		 365 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  35.78 
 
 		 633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.91 
 
 		 484 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  30.36 
 
 		 549 aa  183  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  38.8 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.71 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.86 
 
 		 490 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  27.7 
 
 		 637 aa  177  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  29.29 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  37.69 
 
 		 544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  29.48 
 
 		 528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  37.32 
 
 		 531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  30.38 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1615  glycoside hydrolase family 3 protein  26.12 
 
 		 523 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.059462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  36.94 
 
 		 544 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2780  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 562 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.330179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.06 
 
 		 490 aa  171  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  27.1 
 
 		 734 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  36.02 
 
 		 575 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0807  glycoside hydrolase family 3 protein  26.98 
 
 		 554 aa  168  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  30.4 
 
 		 537 aa  167  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  36.78 
 
 		 575 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  33.24 
 
 		 386 aa  166  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.82 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.99 
 
 		 387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  30.48 
 
 		 688 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  26.99 
 
 		 759 aa  164  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.43 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.87 
 
 		 530 aa  161  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  28.1 
 
 		 779 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0705  glycosy hydrolase family protein  24.17 
 
 		 596 aa  160  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  36.39 
 
 		 395 aa  160  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  40 
 
 		 468 aa  159  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2600  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.46 
 
 		 575 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121893 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  37.66 
 
 		 673 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>