More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4564 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
624 aa  1278    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  38.98 
 
 
966 aa  365  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.51 
 
 
582 aa  335  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  34.86 
 
 
589 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  36.32 
 
 
585 aa  326  9e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.81 
 
 
583 aa  322  9.000000000000001e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  35.96 
 
 
604 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.77 
 
 
600 aa  317  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.09 
 
 
591 aa  310  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.83 
 
 
573 aa  303  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  32.46 
 
 
592 aa  297  4e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.78 
 
 
543 aa  290  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  32.7 
 
 
1012 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.53 
 
 
1018 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.28 
 
 
953 aa  280  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.81 
 
 
698 aa  280  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.91 
 
 
976 aa  273  8.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.84 
 
 
596 aa  269  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  30.96 
 
 
971 aa  269  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  33.39 
 
 
552 aa  267  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.41 
 
 
568 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  29.9 
 
 
997 aa  263  8e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  28.43 
 
 
990 aa  263  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.11 
 
 
580 aa  259  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.44 
 
 
543 aa  259  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  40.29 
 
 
542 aa  254  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.32 
 
 
558 aa  253  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  37.73 
 
 
444 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  29.97 
 
 
992 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.9 
 
 
552 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  31.12 
 
 
520 aa  248  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.22 
 
 
534 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.22 
 
 
534 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  40.27 
 
 
656 aa  246  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  37.79 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.91 
 
 
618 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  26.75 
 
 
1007 aa  240  6.999999999999999e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.57 
 
 
537 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  34.16 
 
 
1003 aa  234  3e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.74 
 
 
528 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  25.92 
 
 
845 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  36.1 
 
 
631 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.78 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.72 
 
 
1002 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  39.86 
 
 
538 aa  210  8e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  28.62 
 
 
586 aa  207  6e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.79 
 
 
426 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  40.14 
 
 
538 aa  202  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2780  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 
562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.330179  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  35.37 
 
 
549 aa  197  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.19 
 
 
511 aa  193  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  30.41 
 
 
779 aa  191  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  33.61 
 
 
517 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  36.34 
 
 
498 aa  186  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.97 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  29.81 
 
 
759 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  29.47 
 
 
511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  36.22 
 
 
499 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  33.88 
 
 
520 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  27.27 
 
 
537 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  30.32 
 
 
699 aa  178  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.17 
 
 
573 aa  178  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  31.22 
 
 
699 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  31 
 
 
699 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0705  glycosy hydrolase family protein  25.29 
 
 
596 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.6 
 
 
365 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  35.44 
 
 
365 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  34.29 
 
 
365 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  31 
 
 
699 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  34.82 
 
 
374 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  33.05 
 
 
633 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  28.15 
 
 
541 aa  174  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
365 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  29.57 
 
 
688 aa  174  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  32.44 
 
 
575 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  28.43 
 
 
557 aa  172  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  35.08 
 
 
544 aa  170  8e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  32.66 
 
 
575 aa  169  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  28.85 
 
 
637 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  30.81 
 
 
503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  36.23 
 
 
544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  41.05 
 
 
478 aa  166  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.48 
 
 
395 aa  165  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.09 
 
 
598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  27.09 
 
 
923 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.71 
 
 
594 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.6 
 
 
482 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.07 
 
 
398 aa  161  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 
361 aa  160  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  31.59 
 
 
378 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.85 
 
 
504 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0807  glycoside hydrolase family 3 protein  27.08 
 
 
554 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  33.83 
 
 
490 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.88 
 
 
530 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2890  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.79 
 
 
553 aa  156  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  31.62 
 
 
492 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.07 
 
 
395 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.07 
 
 
490 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.91 
 
 
375 aa  154  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  26.5 
 
 
727 aa  154  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>