More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0169 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
573 aa  1174    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  66.3 
 
 
583 aa  767    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.76 
 
 
591 aa  623  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52 
 
 
582 aa  619  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  51.29 
 
 
589 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  48.81 
 
 
592 aa  521  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  47.97 
 
 
585 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  41.14 
 
 
966 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  32.29 
 
 
624 aa  300  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  33.45 
 
 
604 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.88 
 
 
1018 aa  289  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  31.93 
 
 
992 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.71 
 
 
953 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  33.1 
 
 
1007 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  32.81 
 
 
971 aa  280  7e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  35.24 
 
 
520 aa  279  8e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  30.57 
 
 
990 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.45 
 
 
600 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.11 
 
 
698 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.84 
 
 
596 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.53 
 
 
568 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.41 
 
 
528 aa  256  5e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.94 
 
 
537 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.11 
 
 
976 aa  253  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  29.89 
 
 
1012 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.28 
 
 
543 aa  250  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.95 
 
 
543 aa  249  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  30.52 
 
 
997 aa  247  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  35.91 
 
 
1003 aa  245  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.12 
 
 
1002 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  31.66 
 
 
552 aa  242  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.8 
 
 
558 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.88 
 
 
552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.74 
 
 
618 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.1 
 
 
534 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.1 
 
 
534 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  39.35 
 
 
542 aa  227  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.85 
 
 
580 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  34.82 
 
 
427 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  31.4 
 
 
631 aa  217  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  37.15 
 
 
656 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  36.6 
 
 
543 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  29.83 
 
 
541 aa  203  9e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.75 
 
 
426 aa  199  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  32.7 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  38.43 
 
 
538 aa  198  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.57 
 
 
573 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  28.26 
 
 
517 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.57 
 
 
845 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  38.91 
 
 
538 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  25.89 
 
 
586 aa  192  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  30.63 
 
 
557 aa  191  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.06 
 
 
492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  25.27 
 
 
759 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.43 
 
 
420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.77 
 
 
484 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  33.44 
 
 
549 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  32.16 
 
 
637 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.35 
 
 
511 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1615  glycoside hydrolase family 3 protein  28.85 
 
 
523 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.059462  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  30.25 
 
 
537 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  29.65 
 
 
779 aa  179  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  37.76 
 
 
365 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  40 
 
 
498 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  40.37 
 
 
544 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  40 
 
 
544 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  33.67 
 
 
503 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  35.76 
 
 
499 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.76 
 
 
365 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.76 
 
 
365 aa  173  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  36.18 
 
 
520 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.6 
 
 
490 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.84 
 
 
511 aa  169  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.38 
 
 
594 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  33.82 
 
 
481 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0705  glycosy hydrolase family protein  23.29 
 
 
596 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 
633 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  28.28 
 
 
478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  28.54 
 
 
499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0807  glycoside hydrolase family 3 protein  27.87 
 
 
554 aa  163  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77156  glycosyl hyrolase family 3-like protein  28.21 
 
 
1010 aa  163  9e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.354705  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  36.39 
 
 
365 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  33.52 
 
 
699 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.66 
 
 
598 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  33.24 
 
 
699 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  33.24 
 
 
699 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  29 
 
 
490 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  41.52 
 
 
468 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2780  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 
562 aa  160  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.330179  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  33.24 
 
 
699 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4013  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.42 
 
 
559 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  27.31 
 
 
528 aa  157  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  37.98 
 
 
575 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  25.95 
 
 
923 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22490  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.9 
 
 
412 aa  157  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.796827 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  29.26 
 
 
688 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.11 
 
 
358 aa  154  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  36.43 
 
 
575 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  32.38 
 
 
673 aa  150  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  33.52 
 
 
375 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>