More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1481 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  96.14 
 
 
544 aa  1015    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
544 aa  1109    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  45.62 
 
 
543 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  46.62 
 
 
549 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  45.1 
 
 
538 aa  474  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  45.16 
 
 
538 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  39.45 
 
 
542 aa  354  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.33 
 
 
552 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.76 
 
 
534 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.76 
 
 
534 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.62 
 
 
537 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  40.3 
 
 
966 aa  226  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.89 
 
 
698 aa  216  9e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.8 
 
 
591 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  36.67 
 
 
589 aa  210  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.46 
 
 
573 aa  207  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  42.41 
 
 
656 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.76 
 
 
528 aa  205  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  32.52 
 
 
992 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.73 
 
 
583 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  41.03 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.54 
 
 
568 aa  200  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  43.72 
 
 
631 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  35.04 
 
 
604 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  36.73 
 
 
585 aa  195  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  36.68 
 
 
592 aa  195  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.05 
 
 
582 aa  195  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  30.31 
 
 
971 aa  195  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  35.93 
 
 
517 aa  193  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 
365 aa  193  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  37.11 
 
 
444 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.72 
 
 
976 aa  192  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  37.95 
 
 
520 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.33 
 
 
426 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.69 
 
 
365 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.69 
 
 
365 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.96 
 
 
596 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.73 
 
 
511 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  35.88 
 
 
365 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  38.91 
 
 
478 aa  184  3e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  33.43 
 
 
990 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.5 
 
 
543 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.98 
 
 
594 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 
624 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.33 
 
 
845 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  35.69 
 
 
520 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.91 
 
 
387 aa  180  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.06 
 
 
511 aa  180  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.77 
 
 
580 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  39.73 
 
 
503 aa  177  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.31 
 
 
543 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  32.42 
 
 
997 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  37.98 
 
 
552 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  33.87 
 
 
637 aa  173  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  35.5 
 
 
498 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  26.72 
 
 
1003 aa  171  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.24 
 
 
363 aa  171  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.45 
 
 
953 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  36.39 
 
 
499 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.85 
 
 
600 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.6 
 
 
558 aa  170  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 
361 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  40.09 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  32.29 
 
 
1007 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.95 
 
 
1002 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  32.64 
 
 
633 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.07 
 
 
478 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.38 
 
 
420 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.44 
 
 
1018 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  33.55 
 
 
541 aa  159  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.98 
 
 
618 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  32.68 
 
 
673 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33 
 
 
492 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.79 
 
 
484 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  32.81 
 
 
1012 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  30.61 
 
 
923 aa  154  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  39.62 
 
 
468 aa  153  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.37 
 
 
382 aa  151  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.69 
 
 
504 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  32.59 
 
 
734 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.44 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.65 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.56 
 
 
490 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  31.66 
 
 
531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  34.85 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  32.92 
 
 
352 aa  148  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.44 
 
 
365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  35.53 
 
 
557 aa  147  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  28.45 
 
 
357 aa  146  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.58 
 
 
490 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  31.1 
 
 
537 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  29.25 
 
 
382 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  29.81 
 
 
699 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.19 
 
 
395 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.97 
 
 
573 aa  144  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  32.99 
 
 
586 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  29.5 
 
 
699 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.1 
 
 
362 aa  143  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  29.06 
 
 
699 aa  143  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  31.23 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>