More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4196 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.81 
 
 		 953 aa  698    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  38.53 
 
 		 1007 aa  709    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 1002 aa  2075    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  38.38 
 
 		 997 aa  689    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.04 
 
 		 1018 aa  704    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  43.38 
 
 		 990 aa  766    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.9 
 
 		 976 aa  663    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  60.74 
 
 		 992 aa  1242    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  40.24 
 
 		 971 aa  770    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  41.07 
 
 		 1012 aa  710    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  34.07 
 
 		 1003 aa  549  1e-154  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  35.04 
 
 		 966 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.49 
 
 		 568 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  35.86 
 
 		 597 aa  348  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  36.11 
 
 		 603 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  32.6 
 
 		 585 aa  266  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.48 
 
 		 573 aa  266  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.68 
 
 		 583 aa  261  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  35.87 
 
 		 592 aa  261  6e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  30.02 
 
 		 589 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.39 
 
 		 591 aa  253  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.12 
 
 		 582 aa  239  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.03 
 
 		 596 aa  237  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.93 
 
 		 698 aa  235  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  30.62 
 
 		 604 aa  235  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  35.59 
 
 		 624 aa  235  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  31.52 
 
 		 537 aa  229  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.07 
 
 		 534 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.07 
 
 		 534 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  43.84 
 
 		 542 aa  224  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  28.52 
 
 		 520 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.05 
 
 		 537 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.83 
 
 		 543 aa  218  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.38 
 
 		 543 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  34.76 
 
 		 434 aa  214  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  37.26 
 
 		 656 aa  214  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.78 
 
 		 558 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.56 
 
 		 600 aa  212  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.34 
 
 		 552 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  34.31 
 
 		 444 aa  209  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  29.78 
 
 		 699 aa  207  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  29.78 
 
 		 699 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  29.54 
 
 		 699 aa  205  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.78 
 
 		 511 aa  204  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  29.58 
 
 		 699 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.71 
 
 		 528 aa  200  9e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.1 
 
 		 618 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  36.53 
 
 		 633 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  29.74 
 
 		 845 aa  197  9e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.52 
 
 		 484 aa  197  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  30.43 
 
 		 538 aa  196  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  32.23 
 
 		 381 aa  196  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  36.07 
 
 		 538 aa  194  6e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  33.33 
 
 		 427 aa  192  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.83 
 
 		 580 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.99 
 
 		 598 aa  189  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  32.04 
 
 		 385 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  32.9 
 
 		 574 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  29.29 
 
 		 552 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  31.87 
 
 		 517 aa  184  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  43.15 
 
 		 499 aa  184  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  35.06 
 
 		 395 aa  184  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.24 
 
 		 511 aa  182  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  41.77 
 
 		 498 aa  180  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.34 
 
 		 520 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  30.81 
 
 		 379 aa  179  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  36.79 
 
 		 673 aa  179  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  28.94 
 
 		 734 aa  179  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  33.6 
 
 		 631 aa  179  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  36.13 
 
 		 503 aa  179  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  31.99 
 
 		 566 aa  177  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  32.6 
 
 		 452 aa  177  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  32.6 
 
 		 428 aa  177  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  37.74 
 
 		 549 aa  177  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  30.71 
 
 		 688 aa  174  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  30.65 
 
 		 543 aa  173  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  32.28 
 
 		 379 aa  174  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  30.02 
 
 		 557 aa  171  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.94 
 
 		 365 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.94 
 
 		 365 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.88 
 
 		 492 aa  171  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  35.15 
 
 		 365 aa  171  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  35.35 
 
 		 365 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.29 
 
 		 594 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  31.47 
 
 		 379 aa  170  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.88 
 
 		 426 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  35.87 
 
 		 637 aa  169  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  31.79 
 
 		 381 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.38 
 
 		 398 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.44 
 
 		 373 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.76 
 
 		 420 aa  168  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  30.05 
 
 		 717 aa  167  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  31.46 
 
 		 793 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.76 
 
 		 478 aa  167  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  30.67 
 
 		 395 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  26.53 
 
 		 541 aa  166  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  32.35 
 
 		 361 aa  165  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  30.85 
 
 		 391 aa  164  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.37 
 
 		 387 aa  163  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.76 
 
 		 382 aa  160  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>