More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22490 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22490  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  100 
 
 
412 aa  837    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.796827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 
444 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.83 
 
 
618 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  36.81 
 
 
656 aa  209  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  37.32 
 
 
427 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.5 
 
 
698 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  37.71 
 
 
552 aa  196  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.05 
 
 
543 aa  196  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.62 
 
 
600 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  34.88 
 
 
604 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.78 
 
 
580 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.83 
 
 
420 aa  193  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.17 
 
 
528 aa  186  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.7 
 
 
426 aa  186  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.07 
 
 
558 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.08 
 
 
511 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  33.75 
 
 
845 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  33.11 
 
 
517 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  39.13 
 
 
520 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  34.79 
 
 
631 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2332  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.93 
 
 
409 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.77 
 
 
543 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  39.77 
 
 
490 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.71 
 
 
591 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.62 
 
 
596 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  32.29 
 
 
589 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  32.24 
 
 
971 aa  165  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  32.88 
 
 
633 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.54 
 
 
484 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.9 
 
 
573 aa  164  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  38.08 
 
 
592 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  36.08 
 
 
575 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.64 
 
 
582 aa  162  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  33.33 
 
 
966 aa  162  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.22 
 
 
492 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  32.14 
 
 
520 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08060  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  44.97 
 
 
540 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000859864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  36.79 
 
 
386 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  34.57 
 
 
575 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  33.71 
 
 
585 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.33 
 
 
490 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.94 
 
 
511 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  30.79 
 
 
1003 aa  154  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  32.95 
 
 
624 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  31.58 
 
 
531 aa  154  2.9999999999999998e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.88 
 
 
503 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.88 
 
 
504 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.47 
 
 
537 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.38 
 
 
499 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  37.25 
 
 
498 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  28.18 
 
 
395 aa  149  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  32.94 
 
 
542 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.53 
 
 
552 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.07 
 
 
976 aa  147  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  36.15 
 
 
336 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  36.26 
 
 
336 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.67 
 
 
583 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  31.3 
 
 
1007 aa  145  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  29.03 
 
 
382 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  29.35 
 
 
382 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  35.16 
 
 
336 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.800701 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  31.78 
 
 
923 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 
361 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  28.26 
 
 
363 aa  143  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.4 
 
 
534 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  29.95 
 
 
1012 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.4 
 
 
534 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  35 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  30.59 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  29.86 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.04 
 
 
362 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1990  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.65 
 
 
372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.639682  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  35.86 
 
 
499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  32.23 
 
 
990 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  34.87 
 
 
332 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  28.44 
 
 
997 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  32.43 
 
 
356 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  39.56 
 
 
544 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  29.46 
 
 
557 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  36.57 
 
 
544 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.21 
 
 
381 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.25 
 
 
482 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  32.62 
 
 
673 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0002  glycosyl hydrolase family 3 N domain protein  32.44 
 
 
342 aa  138  2e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  34.23 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  28.27 
 
 
528 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  32.8 
 
 
481 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  34.23 
 
 
336 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.79 
 
 
379 aa  136  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.22 
 
 
594 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.01 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  32.41 
 
 
357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  38.31 
 
 
538 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  32.55 
 
 
365 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  29.06 
 
 
351 aa  133  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.45 
 
 
392 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.5 
 
 
343 aa  133  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.89 
 
 
530 aa  133  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  31.83 
 
 
541 aa  133  6.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.21 
 
 
365 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>