More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08060 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08060  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  100 
 
 		 540 aa  1104    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000859864 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22490  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  44.97 
 
 		 412 aa  149  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.796827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  40.43 
 
 		 656 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  40.93 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  38.22 
 
 		 631 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  37.7 
 
 		 604 aa  121  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  36.41 
 
 		 589 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.44 
 
 		 618 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  34.39 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.11 
 
 		 580 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  36.92 
 
 		 542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  32.64 
 
 		 624 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33 
 
 		 698 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.57 
 
 		 600 aa  110  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  33.67 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.35 
 
 		 558 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  33.61 
 
 		 966 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  34.39 
 
 		 592 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.22 
 
 		 583 aa  107  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2332  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.03 
 
 		 409 aa  107  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  34.59 
 
 		 552 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.9 
 
 		 528 aa  106  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.85 
 
 		 596 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.34 
 
 		 573 aa  104  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.03 
 
 		 484 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.33 
 
 		 582 aa  103  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  33.99 
 
 		 750 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.68 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.99 
 
 		 537 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.46 
 
 		 492 aa  100  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.8 
 
 		 591 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.48 
 
 		 490 aa  99.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  32.38 
 
 		 541 aa  97.8  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.87 
 
 		 534 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  33.33 
 
 		 585 aa  96.3  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  32.11 
 
 		 386 aa  96.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.87 
 
 		 534 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  31.71 
 
 		 759 aa  95.1  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  32.6 
 
 		 538 aa  94.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  33.51 
 
 		 575 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  32.02 
 
 		 575 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.47 
 
 		 543 aa  92.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  31.41 
 
 		 739 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.41 
 
 		 552 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  32.64 
 
 		 503 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  29.95 
 
 		 1003 aa  90.5  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.74 
 
 		 520 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.06 
 
 		 426 aa  89.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.41 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  30.61 
 
 		 557 aa  89  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.55 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0897745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 		 755 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  28.87 
 
 		 393 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  29.02 
 
 		 361 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.3 
 
 		 976 aa  87.8  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  30.89 
 
 		 490 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.27 
 
 		 395 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  31.38 
 
 		 1012 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 		 544 aa  87.4  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  32.97 
 
 		 335 aa  87  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.21 
 
 		 511 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  30.37 
 
 		 758 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.57 
 
 		 573 aa  85.1  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.38 
 
 		 594 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  31.38 
 
 		 990 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  29.94 
 
 		 544 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3167  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.2 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252076 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  29.23 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  34.69 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  32.64 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0523  Beta-glucosidase-related glycosidase  30.89 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.328579  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  30.37 
 
 		 820 aa  83.2  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  26.6 
 
 		 586 aa  81.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  25.69 
 
 		 845 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 		 953 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.05 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.99 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  29.17 
 
 		 997 aa  80.5  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  28.42 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  33.16 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.26 
 
 		 343 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6974  glycoside hydrolase family 3 protein  32.97 
 
 		 337 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.79 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  30.98 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  28.5 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.81 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  32.12 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1007 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08090  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.79 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1221  glycosy hydrolase family protein  27.75 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.98 
 
 		 615 aa  77  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.62 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  32.62 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  29.27 
 
 		 923 aa  77  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.95 
 
 		 736 aa  77  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2290  glycoside hydrolase family 3 protein  29.26 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  27.66 
 
 		 992 aa  77  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.8 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  27.37 
 
 		 971 aa  76.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.65 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>