More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2585 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  98.38 
 
 
434 aa  886    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  72.92 
 
 
432 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  98.85 
 
 
434 aa  889    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  72.92 
 
 
432 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  73.15 
 
 
432 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  98.38 
 
 
434 aa  886    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  72.92 
 
 
432 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  72.92 
 
 
432 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  899    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  98.38 
 
 
434 aa  882    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  98.61 
 
 
434 aa  887    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  46.4 
 
 
651 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  45.54 
 
 
665 aa  374  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  44.31 
 
 
818 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  42.2 
 
 
484 aa  309  5e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  35.37 
 
 
428 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  35.37 
 
 
452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  36.25 
 
 
603 aa  200  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  35.91 
 
 
1012 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  33.33 
 
 
574 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  33.33 
 
 
597 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  31.64 
 
 
966 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  36.59 
 
 
591 aa  182  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.49 
 
 
582 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  34 
 
 
566 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  32.73 
 
 
717 aa  172  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  30.38 
 
 
361 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.76 
 
 
1018 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.68 
 
 
953 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  32.52 
 
 
793 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  31.86 
 
 
390 aa  155  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  31.79 
 
 
379 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  31.78 
 
 
395 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  32.78 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  31.06 
 
 
361 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  31.88 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  29.33 
 
 
379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.73 
 
 
385 aa  146  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  34.18 
 
 
790 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  32.29 
 
 
992 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  31.2 
 
 
796 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  31.2 
 
 
796 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  30.59 
 
 
379 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  30.91 
 
 
784 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.02 
 
 
1002 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  29.17 
 
 
447 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.79 
 
 
381 aa  143  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  28.99 
 
 
1003 aa  141  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  28.99 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  29.34 
 
 
971 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  31.11 
 
 
357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  33.44 
 
 
792 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  31.72 
 
 
416 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  28.85 
 
 
528 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  29.82 
 
 
990 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  28.85 
 
 
528 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  27.53 
 
 
1007 aa  137  4e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  30.61 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  29.72 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  33.44 
 
 
785 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  28.85 
 
 
531 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  28.3 
 
 
997 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  32.36 
 
 
337 aa  134  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  33.85 
 
 
354 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  32.22 
 
 
547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  30.08 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  31.98 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  32.35 
 
 
366 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  30.03 
 
 
381 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  28.51 
 
 
496 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  29.38 
 
 
395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  31.79 
 
 
415 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  31.38 
 
 
430 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  30.45 
 
 
459 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.55 
 
 
976 aa  126  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  27.59 
 
 
471 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  28.57 
 
 
426 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  30.38 
 
 
433 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  31.09 
 
 
483 aa  123  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  30.66 
 
 
336 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  30.62 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  27.1 
 
 
613 aa  116  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  27.22 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  27.06 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  27.58 
 
 
434 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  27.25 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  30.25 
 
 
334 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  27.53 
 
 
424 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  32.12 
 
 
369 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  25.74 
 
 
424 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  26.81 
 
 
452 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  27.71 
 
 
420 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  26.81 
 
 
422 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  26.1 
 
 
435 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  31.02 
 
 
344 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  29.07 
 
 
377 aa  107  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  26.73 
 
 
438 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  25.95 
 
 
424 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  24.26 
 
 
431 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  25.13 
 
 
397 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0784108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>