More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0505 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  85.88 
 
 
759 aa  1392    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  100 
 
 
779 aa  1606    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  47.55 
 
 
586 aa  553  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.78 
 
 
573 aa  526  1e-148  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0705  glycosy hydrolase family protein  39.2 
 
 
596 aa  439  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2780  glycoside hydrolase family protein  36.82 
 
 
562 aa  293  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.330179  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0807  glycoside hydrolase family 3 protein  32.11 
 
 
554 aa  274  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1615  glycoside hydrolase family 3 protein  33.47 
 
 
523 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.059462  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4013  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.24 
 
 
559 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.76 
 
 
543 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  59.87 
 
 
176 aa  193  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 
624 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  61.25 
 
 
183 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.868196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  58.06 
 
 
163 aa  183  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  57.69 
 
 
170 aa  182  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.09 
 
 
583 aa  180  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.18 
 
 
698 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  51.69 
 
 
181 aa  178  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  32.23 
 
 
604 aa  179  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.65 
 
 
573 aa  179  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  28.96 
 
 
971 aa  177  9e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.68 
 
 
600 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.78 
 
 
176 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  53.12 
 
 
178 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.03 
 
 
1018 aa  174  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  50.31 
 
 
170 aa  173  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  54.97 
 
 
169 aa  172  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.21 
 
 
976 aa  171  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  53.05 
 
 
167 aa  170  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.14 
 
 
953 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3722  gluconate kinase  54.72 
 
 
160 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.69 
 
 
528 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  51.88 
 
 
167 aa  169  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  53.64 
 
 
171 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  53.64 
 
 
171 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  53.64 
 
 
171 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0473  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.04 
 
 
200 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3198  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  56.25 
 
 
166 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000236698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  28.29 
 
 
997 aa  165  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  53.75 
 
 
166 aa  165  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  29.87 
 
 
585 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3976  Gluconokinase  52.9 
 
 
237 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681946  normal  0.192181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  32.05 
 
 
427 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  30.12 
 
 
966 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  27.67 
 
 
1003 aa  162  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.15 
 
 
174 aa  161  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  28.1 
 
 
589 aa  160  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  28.82 
 
 
990 aa  160  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.39 
 
 
582 aa  160  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.51 
 
 
558 aa  160  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.57 
 
 
618 aa  159  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  51.27 
 
 
184 aa  158  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.77 
 
 
185 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  50.3 
 
 
180 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  50.6 
 
 
174 aa  156  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.92 
 
 
591 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2356  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.27 
 
 
182 aa  155  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.63212  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  48.77 
 
 
164 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.3 
 
 
185 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  49.04 
 
 
174 aa  153  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1404  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  44.2 
 
 
627 aa  154  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214778  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  46.99 
 
 
429 aa  153  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  29.49 
 
 
592 aa  153  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.77 
 
 
165 aa  153  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  49.08 
 
 
178 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  49.38 
 
 
165 aa  153  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2070  carbohydrate kinase  53.8 
 
 
174 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280149  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.82 
 
 
179 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.55 
 
 
175 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.62 
 
 
176 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  48.05 
 
 
198 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.24 
 
 
178 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  30.46 
 
 
520 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0926  gluconate kinase  50 
 
 
202 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  45.12 
 
 
171 aa  149  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0162  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.96 
 
 
181 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.45 
 
 
200 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.67 
 
 
182 aa  148  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  48.12 
 
 
167 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  48.12 
 
 
167 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0630  carbohydrate kinase  48.12 
 
 
167 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  46.11 
 
 
167 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  50 
 
 
167 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  48.47 
 
 
167 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  46.11 
 
 
167 aa  147  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0180  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  48.12 
 
 
167 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  48.12 
 
 
167 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  46.11 
 
 
167 aa  147  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  29.87 
 
 
444 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  48.47 
 
 
169 aa  145  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3273  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  47.13 
 
 
178 aa  145  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  30.79 
 
 
552 aa  145  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.3 
 
 
178 aa  145  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  48.41 
 
 
167 aa  145  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.12 
 
 
172 aa  144  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  29.95 
 
 
656 aa  144  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.85 
 
 
169 aa  144  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.3 
 
 
596 aa  144  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0352  thermoresistant gluconokinase  45.68 
 
 
168 aa  143  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.947295  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.63 
 
 
169 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>