More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0807 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0807  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 554 aa  1139    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4013  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.56 
 
 		 559 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1615  glycoside hydrolase family 3 protein  43.42 
 
 		 523 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.059462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2780  glycoside hydrolase family protein  38.04 
 
 		 562 aa  322  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.330179  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  32.02 
 
 		 586 aa  294  3e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0705  glycosy hydrolase family protein  32.72 
 
 		 596 aa  280  7e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  32.11 
 
 		 779 aa  274  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  32.06 
 
 		 759 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.71 
 
 		 573 aa  269  1e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  29.61 
 
 		 604 aa  187  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.09 
 
 		 543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.5 
 
 		 698 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  28.52 
 
 		 966 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  27.78 
 
 		 520 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  26.98 
 
 		 589 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.44 
 
 		 582 aa  166  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.49 
 
 		 528 aa  166  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  27.02 
 
 		 618 aa  166  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.05 
 
 		 600 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.73 
 
 		 558 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.18 
 
 		 583 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.63 
 
 		 596 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.66 
 
 		 573 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  28.23 
 
 		 552 aa  156  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  26.66 
 
 		 624 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.99 
 
 		 591 aa  151  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.64 
 
 		 543 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  27.92 
 
 		 631 aa  147  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  24.86 
 
 		 592 aa  146  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  30.28 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  25.83 
 
 		 845 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.21 
 
 		 580 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  27.22 
 
 		 517 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  27.37 
 
 		 656 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.9 
 
 		 537 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  26.78 
 
 		 585 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  28.74 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.78 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.78 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  29.82 
 
 		 541 aa  128  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  24.88 
 
 		 997 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  23.63 
 
 		 971 aa  127  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  25.23 
 
 		 992 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  26 
 
 		 688 aa  123  9e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1007 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  28.3 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  28.33 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  30.59 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  25.35 
 
 		 699 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.2 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  25.35 
 
 		 699 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  27.03 
 
 		 699 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  26.4 
 
 		 699 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  33.1 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.39 
 
 		 552 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  23.56 
 
 		 976 aa  117  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  24.27 
 
 		 990 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22490  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.87 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.796827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  26.06 
 
 		 734 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  28.3 
 
 		 575 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.68 
 
 		 1018 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  29.92 
 
 		 575 aa  114  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.18 
 
 		 598 aa  113  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  30.56 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  31.06 
 
 		 342 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  27.2 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  30.72 
 
 		 327 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.21 
 
 		 490 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  29.75 
 
 		 361 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.18 
 
 		 392 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  31.52 
 
 		 337 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.53 
 
 		 953 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.96 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 633 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.8 
 
 		 341 aa  108  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  27.07 
 
 		 382 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  29.97 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.38 
 
 		 484 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  23.09 
 
 		 528 aa  106  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  30.43 
 
 		 341 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  30.43 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  30.43 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  30.43 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  30.43 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  30.43 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  30.43 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1716  beta-hexosaminidase  28.22 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  30.43 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  28.83 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.87 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  26.19 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  30.18 
 
 		 503 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  25.87 
 
 		 1003 aa  104  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  22.72 
 
 		 568 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  30.37 
 
 		 336 aa  103  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.52 
 
 		 347 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  29.67 
 
 		 538 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  21.72 
 
 		 1012 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>