More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2780 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2780  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 562 aa  1129    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.330179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4013  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.62 
 
 		 559 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1615  glycoside hydrolase family 3 protein  38.82 
 
 		 523 aa  357  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.059462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0807  glycoside hydrolase family 3 protein  38.04 
 
 		 554 aa  333  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  34.18 
 
 		 586 aa  327  5e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0705  glycosy hydrolase family protein  32.33 
 
 		 596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  36.89 
 
 		 779 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  36.19 
 
 		 759 aa  297  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.54 
 
 		 573 aa  282  1e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  29.24 
 
 		 624 aa  206  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.15 
 
 		 543 aa  200  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.06 
 
 		 583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  30.15 
 
 		 585 aa  196  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.66 
 
 		 698 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  33.95 
 
 		 604 aa  193  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.57 
 
 		 591 aa  188  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  33.88 
 
 		 966 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.28 
 
 		 596 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  33.76 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  27.47 
 
 		 589 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.77 
 
 		 600 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.36 
 
 		 580 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.56 
 
 		 976 aa  176  7e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.37 
 
 		 618 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.6 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  29.96 
 
 		 592 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.79 
 
 		 528 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.52 
 
 		 558 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.09 
 
 		 573 aa  170  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.03 
 
 		 543 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  34.82 
 
 		 631 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  32.51 
 
 		 656 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  32.76 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  29.7 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1007 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  26.62 
 
 		 971 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  31.88 
 
 		 542 aa  162  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.32 
 
 		 953 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.08 
 
 		 420 aa  160  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  27.65 
 
 		 688 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  25.74 
 
 		 845 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.87 
 
 		 365 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  35.87 
 
 		 365 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.87 
 
 		 365 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.39 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.85 
 
 		 1018 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  28.67 
 
 		 992 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.07 
 
 		 490 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  33.97 
 
 		 520 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.08 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.47 
 
 		 484 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.77 
 
 		 537 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.1 
 
 		 568 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.99 
 
 		 534 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.99 
 
 		 534 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  27.48 
 
 		 1003 aa  144  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.74 
 
 		 552 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  36.5 
 
 		 365 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.2 
 
 		 598 aa  143  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.6 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.48 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  37.34 
 
 		 498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  27.16 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 		 633 aa  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  26.39 
 
 		 1012 aa  140  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  27.07 
 
 		 997 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  37.34 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  26.37 
 
 		 990 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  29.34 
 
 		 395 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.77 
 
 		 358 aa  137  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.56 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  30.92 
 
 		 699 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  31.4 
 
 		 374 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  31.43 
 
 		 699 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 		 468 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.47 
 
 		 504 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.47 
 
 		 503 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  30.64 
 
 		 699 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.78 
 
 		 594 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  30.71 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  30.64 
 
 		 699 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  31.13 
 
 		 538 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.07 
 
 		 395 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  30.56 
 
 		 538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  31.76 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.97 
 
 		 379 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.1 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22490  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.05 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.796827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  29.63 
 
 		 511 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.93 
 
 		 482 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  30.87 
 
 		 549 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.44 
 
 		 1002 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  31.54 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  33.45 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  33.67 
 
 		 575 aa  124  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  26.44 
 
 		 637 aa  123  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  33.11 
 
 		 575 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.72 
 
 		 511 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.63 
 
 		 373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>