199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2114 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  100 
 
 
170 aa  345  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  64.33 
 
 
176 aa  216  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  59.12 
 
 
176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  57.14 
 
 
167 aa  191  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  58.23 
 
 
167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1135  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.65 
 
 
181 aa  181  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0310526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  55.97 
 
 
163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  57.79 
 
 
779 aa  180  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  54.94 
 
 
169 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  56.41 
 
 
170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3528  gluconate kinase  54.43 
 
 
181 aa  177  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  55.97 
 
 
171 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  55.97 
 
 
171 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  55.97 
 
 
171 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  55.13 
 
 
759 aa  176  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  54.84 
 
 
198 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.33 
 
 
176 aa  174  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3976  Gluconokinase  60.84 
 
 
237 aa  174  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681946  normal  0.192181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  54.49 
 
 
174 aa  174  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54 
 
 
178 aa  169  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.72 
 
 
167 aa  168  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3722  gluconate kinase  55.77 
 
 
160 aa  167  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3198  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.23 
 
 
166 aa  166  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000236698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.28 
 
 
200 aa  165  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0597  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.74 
 
 
170 aa  161  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.188673  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0162  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.55 
 
 
181 aa  157  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.43 
 
 
174 aa  157  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  49.4 
 
 
184 aa  156  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  44.17 
 
 
191 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  44.17 
 
 
191 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  44.17 
 
 
191 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  54.19 
 
 
156 aa  155  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.56 
 
 
186 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2356  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.04 
 
 
182 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.63212  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.53 
 
 
183 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.868196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.53 
 
 
165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  49.34 
 
 
178 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  52.41 
 
 
167 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3273  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  46.39 
 
 
178 aa  150  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  46.3 
 
 
164 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  44.31 
 
 
176 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  46.54 
 
 
167 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0630  carbohydrate kinase  45.91 
 
 
167 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  44.31 
 
 
176 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  45.06 
 
 
186 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.01 
 
 
207 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0180  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  45.91 
 
 
167 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  45.91 
 
 
167 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.03 
 
 
175 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  44.31 
 
 
176 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  44.31 
 
 
176 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  44.31 
 
 
176 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  46.79 
 
 
181 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  49.03 
 
 
174 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  45.91 
 
 
167 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  45.91 
 
 
167 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  47.13 
 
 
429 aa  147  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  43.83 
 
 
175 aa  147  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.17 
 
 
169 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3749  gluconate kinase  44.65 
 
 
167 aa  147  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  47.74 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0983  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.52 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0150853  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.95 
 
 
208 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.94 
 
 
161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  48.7 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  44.1 
 
 
182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  44.1 
 
 
175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.94 
 
 
161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.8 
 
 
169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  44.1 
 
 
175 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.68 
 
 
178 aa  145  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  44.1 
 
 
175 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  42.33 
 
 
172 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  55.73 
 
 
188 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  44.1 
 
 
175 aa  145  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  44.1 
 
 
175 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  40.24 
 
 
174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4753  gluconate kinase 1  44.1 
 
 
182 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.986563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1082  gluconate kinase  52.26 
 
 
168 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2645  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  47.02 
 
 
172 aa  144  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.72 
 
 
182 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4889  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.23 
 
 
173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  43.95 
 
 
167 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  43.95 
 
 
167 aa  143  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1046  gluconate kinase  50.96 
 
 
171 aa  143  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000585509  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0473  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.02 
 
 
200 aa  143  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  43.95 
 
 
167 aa  143  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.71 
 
 
185 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  44.59 
 
 
178 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.59 
 
 
179 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  44.59 
 
 
178 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.37 
 
 
190 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  42.77 
 
 
173 aa  142  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  44.79 
 
 
167 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.98 
 
 
175 aa  141  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  43.75 
 
 
172 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  43.75 
 
 
171 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  43.75 
 
 
172 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  43.75 
 
 
172 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  42.77 
 
 
187 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>