192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00513 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  100 
 
 
173 aa  358  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  86.39 
 
 
174 aa  305  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  80.47 
 
 
171 aa  296  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  72.05 
 
 
174 aa  256  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  61.59 
 
 
172 aa  218  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  62.89 
 
 
167 aa  215  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  62.89 
 
 
167 aa  215  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  62.89 
 
 
167 aa  215  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  60.84 
 
 
170 aa  214  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  56.9 
 
 
178 aa  214  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  56.9 
 
 
178 aa  214  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  59.88 
 
 
178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  61.64 
 
 
175 aa  209  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  59.38 
 
 
172 aa  204  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  59.04 
 
 
178 aa  202  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  57.5 
 
 
175 aa  202  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2932  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  59.12 
 
 
174 aa  192  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.716161  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  57.93 
 
 
191 aa  190  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  57.93 
 
 
191 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  57.93 
 
 
191 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  57.32 
 
 
186 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  54.49 
 
 
187 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.49 
 
 
187 aa  184  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  54.49 
 
 
187 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  54.49 
 
 
187 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4524  D-gluconate kinase  54.17 
 
 
187 aa  184  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0329306  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  53.12 
 
 
186 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  52.5 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  52.5 
 
 
175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  52.5 
 
 
175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  52.5 
 
 
175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  52.5 
 
 
175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4753  gluconate kinase 1  52.5 
 
 
182 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.986563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  51.88 
 
 
182 aa  180  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0278  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.53 
 
 
162 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3809  gluconate kinase 1  52.53 
 
 
164 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3731  gluconate kinase 1  52.53 
 
 
164 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3851  gluconate kinase 1  52.53 
 
 
164 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0276  gluconate kinase 1  52.53 
 
 
162 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  50 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  50 
 
 
176 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  54.09 
 
 
176 aa  177  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  54.09 
 
 
176 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  54.09 
 
 
176 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  54.09 
 
 
176 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3911  gluconate kinase 1  51.27 
 
 
164 aa  173  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.652303 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.5 
 
 
185 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  47.31 
 
 
178 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  49.06 
 
 
181 aa  164  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.08 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4497  gluconate kinase 1  48.12 
 
 
179 aa  160  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0404487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  45.81 
 
 
180 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  47.1 
 
 
167 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4650  gluconate kinase 1  45 
 
 
175 aa  158  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.648284 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.75 
 
 
185 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.83 
 
 
174 aa  154  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  45.51 
 
 
429 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.91 
 
 
178 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.38 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3337  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.65 
 
 
175 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00678717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.94 
 
 
179 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  47.74 
 
 
169 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  45.16 
 
 
170 aa  149  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  45.34 
 
 
166 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.77 
 
 
161 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.77 
 
 
161 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  45 
 
 
178 aa  147  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.81 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0926  gluconate kinase  46.79 
 
 
202 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  45.86 
 
 
171 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  45.86 
 
 
171 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  41.56 
 
 
166 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  45.86 
 
 
171 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3564  gluconokinase  44.16 
 
 
162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00350968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  44.1 
 
 
164 aa  143  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4889  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.95 
 
 
173 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1272  ribose 5-phosphate isomerase  46.41 
 
 
424 aa  142  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5548  carbohydrate kinase  41.51 
 
 
180 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45 
 
 
176 aa  142  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  42.77 
 
 
170 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2732  gluconate kinase  46.32 
 
 
170 aa  141  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689831  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.57 
 
 
163 aa  141  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  43.11 
 
 
165 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  43.64 
 
 
174 aa  140  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.8 
 
 
169 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  44.81 
 
 
779 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.14 
 
 
165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3722  gluconate kinase  42.21 
 
 
160 aa  137  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0983  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.53 
 
 
165 aa  137  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0150853  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.25 
 
 
200 aa  137  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  44 
 
 
156 aa  137  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3976  Gluconokinase  45.1 
 
 
237 aa  137  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681946  normal  0.192181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.23 
 
 
169 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  44.3 
 
 
188 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4336  gluconate kinase  40.62 
 
 
177 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  44.94 
 
 
169 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2785  carbohydrate kinase  42.41 
 
 
179 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.67 
 
 
167 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.59 
 
 
759 aa  136  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.74 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>