182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5548 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5548  carbohydrate kinase  100 
 
 
180 aa  367  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2785  carbohydrate kinase  55.56 
 
 
179 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3416  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  55.56 
 
 
179 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0373306  normal  0.327266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34640  gluconokinase  56.02 
 
 
173 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.425531  normal  0.105648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2346  carbohydrate kinase  55.56 
 
 
179 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2524  carbohydrate kinase  55.56 
 
 
179 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4336  gluconate kinase  55.17 
 
 
177 aa  192  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2939  gluconokinase  56.02 
 
 
173 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27310  gluconokinase  62.42 
 
 
175 aa  191  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22480  gluconokinase  60.78 
 
 
174 aa  191  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3337  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  56.55 
 
 
175 aa  190  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00678717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1235  carbohydrate kinase  57.83 
 
 
189 aa  190  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3028  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  55.25 
 
 
196 aa  188  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3564  gluconokinase  58.02 
 
 
162 aa  187  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00350968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3761  carbohydrate kinase  55.56 
 
 
195 aa  168  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117774  decreased coverage  0.00501521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2569  carbohydrate kinase  50.31 
 
 
373 aa  158  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00777638  hitchhiker  0.0000000380765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  47.5 
 
 
181 aa  157  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.68 
 
 
179 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.97 
 
 
185 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.8 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.616409  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.63 
 
 
178 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0327  carbohydrate kinase  54.37 
 
 
167 aa  150  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2053  carbohydrate kinase  48.19 
 
 
182 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402003  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.97 
 
 
185 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  43.23 
 
 
171 aa  147  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  47.17 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  47.17 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  47.17 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2797  gluconate kinase  50.3 
 
 
209 aa  144  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.654483  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  41.32 
 
 
174 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  43.64 
 
 
166 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  41.51 
 
 
173 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  39.24 
 
 
174 aa  142  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0956  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  48.24 
 
 
189 aa  141  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  50.32 
 
 
167 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  48.72 
 
 
174 aa  140  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  49.32 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  45.75 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.39 
 
 
175 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.95 
 
 
208 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.11 
 
 
175 aa  137  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  48.73 
 
 
178 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.67 
 
 
170 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.36 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  43.14 
 
 
166 aa  134  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  43.48 
 
 
176 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  43.48 
 
 
176 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  43.48 
 
 
176 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  43.48 
 
 
176 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  43.48 
 
 
176 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.21 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  38.96 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  38.96 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0926  gluconate kinase  46 
 
 
202 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2356  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.81 
 
 
182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.63212  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  47.95 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  48.3 
 
 
174 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.51 
 
 
176 aa  131  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.86 
 
 
176 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  41.45 
 
 
191 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  41.45 
 
 
191 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9123  gluconokinase  44.08 
 
 
171 aa  130  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.79 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.98 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  43.84 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.22 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  40.79 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  41.73 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0046  carbohydrate kinase  47.2 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.324095 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  41.03 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  38.22 
 
 
187 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  38.22 
 
 
187 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  38.22 
 
 
187 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  48.37 
 
 
198 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  47.92 
 
 
167 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  41.03 
 
 
167 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2070  carbohydrate kinase  46.5 
 
 
174 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280149  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  41.03 
 
 
167 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4524  D-gluconate kinase  38.22 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0329306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.77 
 
 
169 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  37.58 
 
 
187 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  44.67 
 
 
429 aa  127  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3198  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.15 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000236698 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83065  Glucokinase  44 
 
 
189 aa  126  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235802  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1135  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0310526 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3528  gluconate kinase  48.92 
 
 
181 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  42.77 
 
 
167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.93 
 
 
178 aa  124  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  39.76 
 
 
169 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.51 
 
 
167 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4650  gluconate kinase 1  44.78 
 
 
175 aa  121  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.648284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  45.1 
 
 
169 aa  121  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3273  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  42.76 
 
 
178 aa  121  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  41.29 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.1 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2732  gluconate kinase  39.55 
 
 
170 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689831  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  37.89 
 
 
178 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.21 
 
 
759 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2936  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  41.56 
 
 
177 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.300006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.85 
 
 
190 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>