251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0555 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  100 
 
 
167 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.01 
 
 
161 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.01 
 
 
161 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  54.72 
 
 
170 aa  168  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  50.31 
 
 
167 aa  167  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  51.25 
 
 
165 aa  167  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0983  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  57.69 
 
 
165 aa  166  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0150853  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
169 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.86 
 
 
165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0630  carbohydrate kinase  54.23 
 
 
167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0180  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  54.23 
 
 
167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  54.23 
 
 
167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  54.86 
 
 
164 aa  163  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3749  gluconate kinase  54.23 
 
 
167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  54.23 
 
 
167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  56.64 
 
 
167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  54.23 
 
 
167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  50 
 
 
169 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2732  gluconate kinase  46.5 
 
 
170 aa  160  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689831  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.19 
 
 
169 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  51.22 
 
 
174 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4889  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.79 
 
 
173 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  55.48 
 
 
176 aa  158  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  52.11 
 
 
172 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  52.11 
 
 
171 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  52.11 
 
 
173 aa  157  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  52.11 
 
 
172 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  52.11 
 
 
172 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  52.11 
 
 
172 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  52.11 
 
 
172 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  52.11 
 
 
172 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4858  gluconate kinase  48.1 
 
 
155 aa  156  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19412  hitchhiker  0.00000195031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3976  Gluconokinase  53.16 
 
 
237 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681946  normal  0.192181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  52.1 
 
 
180 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.11 
 
 
200 aa  154  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  51.9 
 
 
170 aa  154  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1852  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  56.05 
 
 
167 aa  154  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  51.9 
 
 
169 aa  153  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.68 
 
 
207 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  50 
 
 
178 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  48.77 
 
 
429 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  45.51 
 
 
178 aa  151  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  51.3 
 
 
174 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  45.51 
 
 
178 aa  151  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.82 
 
 
176 aa  150  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2936  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  46.54 
 
 
177 aa  150  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.300006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  55.4 
 
 
188 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3878  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.12 
 
 
180 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.689499  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  49.39 
 
 
171 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1404  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  47.5 
 
 
627 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214778  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  49.39 
 
 
171 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  49.39 
 
 
171 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1046  gluconate kinase  50 
 
 
171 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000585509  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  46.15 
 
 
181 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  48.41 
 
 
166 aa  148  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  51.8 
 
 
178 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.59 
 
 
175 aa  147  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  56.93 
 
 
167 aa  147  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  45.83 
 
 
191 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  45.83 
 
 
191 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  45.83 
 
 
191 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3644  carbohydrate kinase  44.72 
 
 
162 aa  147  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  48.91 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  48.91 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  48.91 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  49.36 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.14 
 
 
186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  51.45 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  51.45 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  51.45 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  48.91 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  48.91 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2356  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.17 
 
 
182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.63212  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0695  carbohydrate kinase  43.04 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
182 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.616409  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  46.81 
 
 
172 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  40.37 
 
 
174 aa  145  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  44.03 
 
 
175 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0242  gluconate kinase  47.88 
 
 
161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2053  carbohydrate kinase  49.37 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402003  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3198  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  55.4 
 
 
166 aa  143  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000236698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0473  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.09 
 
 
200 aa  143  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.9 
 
 
178 aa  143  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  42.33 
 
 
186 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.55 
 
 
178 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  50.33 
 
 
779 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  41.51 
 
 
175 aa  142  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0770  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.17 
 
 
159 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  47.18 
 
 
187 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.18 
 
 
187 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  47.18 
 
 
187 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  49.34 
 
 
156 aa  141  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  47.18 
 
 
187 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  41.51 
 
 
182 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3809  gluconate kinase 1  42.14 
 
 
164 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3731  gluconate kinase 1  42.14 
 
 
164 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4524  D-gluconate kinase  47.18 
 
 
187 aa  141  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0329306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3851  gluconate kinase 1  42.14 
 
 
164 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.77 
 
 
176 aa  140  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>