186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2356 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2356  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  100 
 
 
182 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.63212  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  53.94 
 
 
164 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  53.33 
 
 
165 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.63 
 
 
176 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.52 
 
 
165 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  53.09 
 
 
173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  53.09 
 
 
172 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  53.09 
 
 
172 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  53.09 
 
 
172 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  53.09 
 
 
172 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  53.09 
 
 
172 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  53.09 
 
 
172 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  53.09 
 
 
171 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  45.4 
 
 
181 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  51.85 
 
 
167 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.62 
 
 
178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0180  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  52.83 
 
 
167 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  52.83 
 
 
167 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0630  carbohydrate kinase  52.83 
 
 
167 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.85 
 
 
200 aa  161  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  50.61 
 
 
167 aa  160  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  50.61 
 
 
167 aa  160  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  49.4 
 
 
178 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  49.69 
 
 
174 aa  158  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3749  gluconate kinase  52.2 
 
 
167 aa  158  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.55 
 
 
182 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.93 
 
 
759 aa  156  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.35 
 
 
179 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  49.04 
 
 
170 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  51.92 
 
 
779 aa  154  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  53.61 
 
 
184 aa  154  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1135  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.11 
 
 
181 aa  154  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0310526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.06 
 
 
178 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  46.95 
 
 
180 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0352  thermoresistant gluconokinase  45.78 
 
 
168 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.947295  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0597  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.98 
 
 
170 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.188673  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.03 
 
 
208 aa  150  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  47.47 
 
 
167 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3878  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.18 
 
 
180 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.689499  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.84 
 
 
185 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.17 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  49.69 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  47.53 
 
 
166 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  42.11 
 
 
178 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  43.65 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  51.35 
 
 
167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.85 
 
 
169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.57 
 
 
185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2645  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.3 
 
 
172 aa  144  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3528  gluconate kinase  45.73 
 
 
181 aa  144  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  46.7 
 
 
429 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.85 
 
 
169 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.99 
 
 
207 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.62 
 
 
190 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.57 
 
 
176 aa  143  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  48.55 
 
 
166 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3273  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  45.45 
 
 
178 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  50.65 
 
 
198 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1404  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  46.48 
 
 
627 aa  141  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214778  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.64 
 
 
175 aa  140  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3198  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.45 
 
 
166 aa  140  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000236698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  43.9 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  43.9 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  43.9 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3463  carbohydrate kinase  44.24 
 
 
180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3771  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.64 
 
 
180 aa  138  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  50.68 
 
 
174 aa  137  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4650  gluconate kinase 1  42.42 
 
 
175 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.648284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  42.42 
 
 
175 aa  136  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  42.42 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  42.42 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  42.42 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  42.42 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  42.24 
 
 
186 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4753  gluconate kinase 1  42.42 
 
 
182 aa  135  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.986563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4497  gluconate kinase 1  44.85 
 
 
179 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0404487 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  43.83 
 
 
167 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  42.42 
 
 
182 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4889  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.42 
 
 
173 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.59 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  43.98 
 
 
169 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  47.02 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  42.42 
 
 
178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3436  carbohydrate kinase  45.81 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  42.42 
 
 
178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3731  gluconate kinase 1  42.95 
 
 
164 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3851  gluconate kinase 1  42.95 
 
 
164 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3809  gluconate kinase 1  42.95 
 
 
164 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  38.89 
 
 
171 aa  132  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0278  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.5 
 
 
162 aa  131  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0276  gluconate kinase 1  42.5 
 
 
162 aa  131  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1046  gluconate kinase  45.16 
 
 
171 aa  131  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000585509  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5548  carbohydrate kinase  45.81 
 
 
180 aa  131  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  40.72 
 
 
175 aa  131  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  41.82 
 
 
178 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.1 
 
 
170 aa  131  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2070  carbohydrate kinase  44.1 
 
 
174 aa  131  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280149  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.61 
 
 
175 aa  131  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1082  gluconate kinase  49.03 
 
 
168 aa  131  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  37.89 
 
 
174 aa  131  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>